37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3513 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  100 
 
 		 284 aa  527  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  37.04 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  37.21 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  37.21 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  37.21 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  36.29 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  35.69 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  36.3 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  37.21 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  34.18 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  29.71 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  32.79 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  34.57 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  33.06 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  31.11 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  35.17 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  35.17 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  35.17 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  29.02 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  32.08 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  34.33 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  32 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  27.6 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  38.33 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  31.72 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  26.16 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  29.11 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  29.85 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  29.77 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  31.32 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  28.78 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  35.36 
 
 		 425 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  28.74 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  28.62 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2471  hypothetical protein  30 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  24.82 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>