202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1805 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1805  ribosomal RNA adenine methylase transferase  100 
 
 
194 aa  388  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.395672  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0064  dimethyladenosine transferase  56.32 
 
 
217 aa  227  8e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.516904  normal  0.049347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  29.38 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  29.38 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  26.48 
 
 
271 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10161  dimethyladenosine transferase  29.47 
 
 
276 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  26.09 
 
 
249 aa  58.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  24.87 
 
 
275 aa  57.8  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  28.29 
 
 
280 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1871  dimethyladenosine transferase  28.77 
 
 
254 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0404  dimethyladenosine transferase  27.43 
 
 
235 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.651839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  27.69 
 
 
266 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  27.36 
 
 
269 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  29.05 
 
 
256 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2671  dimethyladenosine transferase  25.14 
 
 
290 aa  55.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1104  dimethyladenosine transferase  28.17 
 
 
230 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1334  ribosomal RNA adenine methylase transferase  26.54 
 
 
273 aa  55.1  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0549098  normal  0.233187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  30.41 
 
 
279 aa  55.1  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1187  dimethyladenosine transferase  24.76 
 
 
274 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  25.95 
 
 
284 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3300  dimethyladenosine transferase  24.88 
 
 
271 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000380546  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  25.34 
 
 
263 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  28.57 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  25.97 
 
 
263 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  26.29 
 
 
280 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  24.86 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  26.02 
 
 
275 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  26.58 
 
 
266 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  24.24 
 
 
272 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  24.86 
 
 
263 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  24.31 
 
 
267 aa  52  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0791  dimethyladenosine transferase  26.8 
 
 
267 aa  52  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000779511  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  24.27 
 
 
278 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  24.74 
 
 
459 aa  52  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  24.34 
 
 
281 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  24.66 
 
 
278 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0062  dimethyladenosine transferase  26.77 
 
 
281 aa  51.6  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  24.72 
 
 
258 aa  51.6  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  24.27 
 
 
278 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07111  dimethyladenosine transferase  26.7 
 
 
282 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.139914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  25.48 
 
 
284 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  25.48 
 
 
284 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1382  dimethyladenosine transferase  25 
 
 
228 aa  51.6  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.462909  normal  0.033279 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  25.48 
 
 
261 aa  51.2  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  27.6 
 
 
257 aa  51.2  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  22 
 
 
253 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  25.51 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1381  ribosomal RNA adenine methylase transferase  27.42 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1053  ribosomal RNA adenine methylase transferase  29.25 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000092435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  25.81 
 
 
276 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0527  ribosomal RNA adenine methylase transferase  23.94 
 
 
279 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.486138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  26.21 
 
 
253 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  29.03 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  24.2 
 
 
262 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09471  dimethyladenosine transferase  25.23 
 
 
291 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0967055 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1220  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  23.12 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00652696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1343  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  23.12 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2510  rRNA adenine N-6-methyltransferase  23.12 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1713  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.12 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.12 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.12 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  22.61 
 
 
271 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1747  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.12 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0257214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  28.34 
 
 
267 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  24.83 
 
 
244 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  26.49 
 
 
259 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  28.19 
 
 
278 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  24.39 
 
 
275 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  27.39 
 
 
290 aa  48.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  21.18 
 
 
289 aa  48.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  24.49 
 
 
288 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  23.86 
 
 
264 aa  47.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  24.03 
 
 
301 aa  47.8  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2059  dimethyladenosine transferase  23.77 
 
 
280 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  22.6 
 
 
305 aa  47.8  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  24.61 
 
 
286 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.29 
 
 
263 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0278  dimethyladenosine transferase  24.89 
 
 
291 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.525697  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  27.46 
 
 
255 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  23.83 
 
 
287 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2090  dimethyladenosine transferase  24.06 
 
 
267 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  27.48 
 
 
256 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  28.34 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1628  dimethyladenosine transferase  27.13 
 
 
258 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0961527  hitchhiker  0.00711372 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0492  ribosomal RNA adenine methylase transferase  22.27 
 
 
270 aa  47.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  23.68 
 
 
283 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1867  dimethyladenosine transferase  26.8 
 
 
258 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  26.4 
 
 
268 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  25.91 
 
 
287 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  22.84 
 
 
281 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  27.5 
 
 
288 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  26.32 
 
 
266 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  25.13 
 
 
305 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1213  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 
295 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.284392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  25 
 
 
276 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  22.22 
 
 
285 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  26.32 
 
 
266 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  25.35 
 
 
227 aa  47  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1571  dimethyladenosine transferase  24.6 
 
 
264 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.836645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>