More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0527 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0527  ribosomal RNA adenine methylase transferase  100 
 
 
279 aa  545  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.486138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
293 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 
291 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  35.17 
 
 
292 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  35.17 
 
 
292 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  35.17 
 
 
292 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  35.17 
 
 
292 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  35.17 
 
 
292 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  35.17 
 
 
292 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  35.17 
 
 
292 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  35.17 
 
 
292 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  35.17 
 
 
292 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  36.39 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  34.83 
 
 
292 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  39.42 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  36.21 
 
 
290 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  31.89 
 
 
302 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  37.14 
 
 
290 aa  141  9e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  35.46 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  39.93 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
297 aa  139  7e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  34.72 
 
 
280 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  32.75 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  32.75 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  40.37 
 
 
275 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  32.99 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  40.22 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  39.05 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
282 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 
289 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  31.77 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  39.55 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  41.04 
 
 
316 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
274 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  37.09 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  32.73 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  38.04 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 
296 aa  126  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  29.24 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  36.06 
 
 
275 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  34.81 
 
 
302 aa  125  9e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  34.7 
 
 
264 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 
281 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  36.12 
 
 
275 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  36.97 
 
 
284 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  34.88 
 
 
459 aa  123  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  35.02 
 
 
280 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  42.68 
 
 
292 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  30.5 
 
 
290 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
272 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  41.01 
 
 
285 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  31.29 
 
 
297 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3555  ribosomal RNA adenine methylase transferase  36.43 
 
 
277 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.819299  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  31.29 
 
 
297 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  32.86 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  30.66 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  34.76 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  33.57 
 
 
295 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  36.93 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
275 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  40.14 
 
 
296 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  35.09 
 
 
273 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4642  dimethyladenosine transferase  34.28 
 
 
294 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0320106  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
276 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4349  dimethyladenosine transferase  34.28 
 
 
294 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
276 aa  118  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 
293 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  34.1 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  40.49 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4556  dimethyladenosine transferase  37.63 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  38.52 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  37.73 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  37.28 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4263  dimethyladenosine transferase  33.92 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  34.59 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  34.7 
 
 
291 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  32.6 
 
 
311 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13300  dimethyladenosine transferase  39.5 
 
 
295 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0481014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  34.3 
 
 
275 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
289 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  36.59 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  39.41 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>