More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0064 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0064  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.516904  normal  0.049347 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1805  ribosomal RNA adenine methylase transferase  56.32 
 
 		 194 aa  227  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.395672  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  34.91 
 
 		 249 aa  96.7  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  31.53 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0791  dimethyladenosine transferase  32.17 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000779511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  30.73 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  29.57 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  29.68 
 
 		 272 aa  74.7  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  30.13 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  31.84 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  29.74 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  30.28 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  28.38 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  27.98 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  30.97 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  28.64 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  27.94 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  30.22 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  32.52 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  29.58 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1871  dimethyladenosine transferase  27.63 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  30.17 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  28.64 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  30.23 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2671  dimethyladenosine transferase  27.14 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  29.33 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  29.11 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  27.04 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  27.7 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  31.07 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  29.3 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  28.73 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  28.64 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  27.7 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  29.11 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  30.05 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  29.56 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  30.05 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0492  ribosomal RNA adenine methylase transferase  28.4 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  28.02 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  29.28 
 
 		 275 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  27.23 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  30.05 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1958  dimethyladenosine transferase  27.62 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.331165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  28.71 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  30.19 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  28.97 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  28.97 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16171  dimethyladenosine transferase  27.42 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  28.11 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  29 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  28.17 
 
 		 459 aa  65.5  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0404  dimethyladenosine transferase  28.64 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.651839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  29.33 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2626  dimethyladenosine transferase  29.95 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0696362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  30.73 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  26.58 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  27.67 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  26.51 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  27.54 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  31.43 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2760  dimethyladenosine transferase  29.95 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  28.71 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  26.54 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  27.1 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  25.56 
 
 		 280 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  29.72 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  29.17 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  28.71 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  29.55 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  28.97 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  25.49 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  28.16 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  27.6 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  30.73 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  26.09 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0591  dimethyladenosine transferase  29.63 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07111  dimethyladenosine transferase  29.73 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.139914 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  26.81 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  26.85 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  28.7 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  25.88 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  28.96 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  29.03 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  30.22 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  29.73 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  27.8 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  26.95 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10161  dimethyladenosine transferase  29.26 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  28.38 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  28.38 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  26.56 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  26.56 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  29.67 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  28.38 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  28.7 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  28.38 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>