More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1661 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1661  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 421 aa  851    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3717  serine hydroxymethyltransferase  73.67 
 
 		 418 aa  630  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1013  glycine hydroxymethyltransferase  73.32 
 
 		 418 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18300  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 425 aa  538  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0624646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 414 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  60.79 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 410 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 412 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.64 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 413 aa  481  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  61.1 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  60.16 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  60.16 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 427 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  60.16 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  56.02 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 425 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 412 aa  476  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  58.69 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 427 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.2 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  59.74 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  56.58 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  56.02 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  53.96 
 
 		 411 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  53.96 
 
 		 411 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  59.06 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  56.44 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 426 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 		 419 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 431 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  58.9 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 431 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 413 aa  463  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  56.5 
 
 		 422 aa  463  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 411 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  55.93 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 412 aa  461  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  59.48 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  52.7 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  55.07 
 
 		 438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  55.92 
 
 		 474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  54.94 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 		 425 aa  450  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  55.73 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>