More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18300 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18300  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 425 aa  874    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0624646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3717  serine hydroxymethyltransferase  69.47 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1013  glycine hydroxymethyltransferase  64.45 
 
 		 418 aa  541  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1661  Glycine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 413 aa  487  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  56.31 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3100  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  55.16 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 		 427 aa  463  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 413 aa  461  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4955  glycine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 416 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  54.85 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  55.1 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 		 427 aa  463  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  55.1 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2907  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.0486853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  54.35 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4246  glycine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2992  serine hydroxymethyltransferase  56.31 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  54.85 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 413 aa  458  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 419 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 434 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  56.52 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  52.67 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  54.85 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  53.66 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  56.52 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  54.85 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  55.18 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 414 aa  448  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  53.54 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 438 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  57.22 
 
 		 566 aa  450  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  54.93 
 
 		 415 aa  451  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_378  serine hydroxymethyltransferase  53.53 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 431 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  55.39 
 
 		 416 aa  444  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  53.75 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  53.75 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  54.35 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  54.3 
 
 		 415 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  54.79 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>