120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0503 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  100 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  82.82 
 
 
292 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  82.82 
 
 
292 aa  522  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  83.16 
 
 
292 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  81.16 
 
 
292 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  80.14 
 
 
292 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  79.73 
 
 
292 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  78.35 
 
 
292 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  78.62 
 
 
292 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  78.62 
 
 
292 aa  488  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  78.28 
 
 
292 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  78.62 
 
 
292 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  78.28 
 
 
292 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  78.28 
 
 
292 aa  488  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  78.97 
 
 
292 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  78.62 
 
 
292 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  77.93 
 
 
292 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  77.59 
 
 
292 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  77.24 
 
 
292 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  77.59 
 
 
292 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  77.59 
 
 
292 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  77.59 
 
 
292 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  75.17 
 
 
292 aa  467  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  65.17 
 
 
296 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  64.48 
 
 
302 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  63.45 
 
 
292 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  61.03 
 
 
292 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  58.62 
 
 
297 aa  368  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  56.8 
 
 
293 aa  353  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  47.16 
 
 
297 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  48.8 
 
 
281 aa  279  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  46.92 
 
 
285 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  47.16 
 
 
297 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  47 
 
 
297 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  46.49 
 
 
297 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  46.02 
 
 
286 aa  275  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  48.28 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  47.97 
 
 
289 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  48.31 
 
 
289 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  47.8 
 
 
305 aa  271  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  47.62 
 
 
289 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  45.08 
 
 
291 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  44.37 
 
 
289 aa  264  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  45.86 
 
 
296 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  47.4 
 
 
278 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  44 
 
 
302 aa  258  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  45.17 
 
 
296 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  45.76 
 
 
292 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  45.76 
 
 
292 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  42.57 
 
 
297 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  41.04 
 
 
313 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  41.33 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  41.33 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  41.67 
 
 
295 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  41 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  41 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  41 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  41 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  40.67 
 
 
295 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  40.2 
 
 
300 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  40.2 
 
 
300 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  41.58 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  41.5 
 
 
312 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  39.53 
 
 
300 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  37.58 
 
 
298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  39.18 
 
 
294 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  42.37 
 
 
297 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  37.97 
 
 
294 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  37.97 
 
 
294 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  40.21 
 
 
304 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  36.73 
 
 
294 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  37.97 
 
 
294 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  36.49 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  34.75 
 
 
309 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  37.6 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  33.78 
 
 
299 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  31.85 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  32.35 
 
 
296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  30.35 
 
 
310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  35.42 
 
 
299 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  29.96 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  31.13 
 
 
299 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  29.66 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  31.94 
 
 
298 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  31.56 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  30.42 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  32.45 
 
 
302 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  32.56 
 
 
298 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  32.56 
 
 
298 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  29.66 
 
 
306 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  30.25 
 
 
306 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  29.25 
 
 
878 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  24.35 
 
 
454 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  24.35 
 
 
461 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  24.49 
 
 
408 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  25.86 
 
 
836 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  21.39 
 
 
886 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  23.5 
 
 
467 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  24.24 
 
 
458 aa  45.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  24.24 
 
 
458 aa  45.8  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>