181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1132 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  100 
 
 		 289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  98.27 
 
 		 289 aa  590  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  93.77 
 
 		 305 aa  568  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  91 
 
 		 289 aa  551  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  79.86 
 
 		 297 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  80.2 
 
 		 297 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  80.2 
 
 		 297 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  79.18 
 
 		 297 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  78.95 
 
 		 291 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  67.13 
 
 		 286 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  66.55 
 
 		 286 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  63.36 
 
 		 289 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  65.4 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  59.6 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  62.02 
 
 		 281 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  60.69 
 
 		 278 aa  353  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  48.8 
 
 		 292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  48.63 
 
 		 302 aa  281  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  47.19 
 
 		 296 aa  278  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  49.32 
 
 		 292 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  48.31 
 
 		 292 aa  271  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  49.32 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  49.32 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  47.6 
 
 		 292 aa  269  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  49.66 
 
 		 292 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  49.66 
 
 		 292 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  49.66 
 
 		 292 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  49.66 
 
 		 292 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  48.3 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  49.49 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  49.32 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  49.15 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  47.99 
 
 		 292 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  49.49 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  49.49 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  49.15 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  49.15 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  49.15 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  49.15 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  47.6 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  46.94 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  47.44 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  46.92 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  47.6 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  43.24 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  44.59 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  44.29 
 
 		 294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  43.84 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  42.09 
 
 		 295 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  42.09 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  42.09 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  42.09 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  42.09 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  42.09 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  42.09 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  42.09 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  44.37 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  43.79 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  44.37 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  42.76 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  43.79 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  43.79 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  41.92 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  42.27 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  43.1 
 
 		 294 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  43.4 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  42.16 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  42.16 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  41.18 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  40.8 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  41.52 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  40.68 
 
 		 312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  41.44 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  37.37 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  37.98 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  36.99 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  33.44 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  34.02 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  35.39 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  34.69 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  35.25 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  36.57 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  33.71 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  36.89 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  30.38 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  36.82 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  34.55 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  34.55 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  32.38 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  31.3 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  30.74 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  24.55 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  27.12 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  26.47 
 
 		 423 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  26.32 
 
 		 886 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  27.38 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2206  U32 family peptidase  28.16 
 
 		 426 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  26.74 
 
 		 434 aa  53.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  23.57 
 
 		 471 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  28.16 
 
 		 444 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>