147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3006 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  100 
 
 
302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  51.5 
 
 
299 aa  301  8.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  49.15 
 
 
299 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  46.74 
 
 
299 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  45.42 
 
 
306 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  45.79 
 
 
298 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  45.42 
 
 
298 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  45.08 
 
 
298 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  43 
 
 
300 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  45.64 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  44.03 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  44.9 
 
 
306 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  42.24 
 
 
306 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  43.33 
 
 
306 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  40.54 
 
 
310 aa  205  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  40.2 
 
 
310 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  40.73 
 
 
302 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  38.44 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  39.73 
 
 
300 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  39.73 
 
 
300 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  42.03 
 
 
297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  34.58 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  39.73 
 
 
294 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  39.73 
 
 
294 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  37 
 
 
286 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  37.58 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  37.58 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  37.58 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  37.58 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  37.58 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  38.03 
 
 
317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  37.58 
 
 
295 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  37.58 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  37.58 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  38 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  39.26 
 
 
294 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  37.37 
 
 
297 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  39.26 
 
 
294 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  35.79 
 
 
300 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  38.41 
 
 
294 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  36.82 
 
 
298 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  37.25 
 
 
286 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  37.29 
 
 
306 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  37.75 
 
 
285 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  35.23 
 
 
297 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  37.8 
 
 
289 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  34.9 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  34.9 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  35.15 
 
 
291 aa  146  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  35.32 
 
 
292 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  36.43 
 
 
292 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  34.9 
 
 
297 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  37.25 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  33.21 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  33.45 
 
 
292 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  37.4 
 
 
278 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  33.45 
 
 
292 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  36.89 
 
 
289 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  35.83 
 
 
296 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  34.85 
 
 
296 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  36.18 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  34.55 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  35.6 
 
 
313 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  35.19 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  35.19 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  34.81 
 
 
292 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  34.81 
 
 
292 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  34.81 
 
 
292 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  35.48 
 
 
281 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  34.81 
 
 
292 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  34.81 
 
 
292 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  34.81 
 
 
292 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  33.93 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  33.95 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  34.44 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  35.42 
 
 
292 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  35.42 
 
 
292 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  34.44 
 
 
292 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  35.42 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  35.06 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  35.06 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  35.31 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  35.06 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  34.33 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  35 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  34.33 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  34.33 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  35.79 
 
 
292 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  35.06 
 
 
292 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  34.81 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  32.45 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  30.32 
 
 
438 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  32.41 
 
 
432 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  28.1 
 
 
471 aa  49.3  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  31.53 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  30.63 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  29.19 
 
 
453 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  31.53 
 
 
469 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  32.74 
 
 
453 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  31.48 
 
 
440 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>