137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3338 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  100 
 
 
292 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  86.25 
 
 
292 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  83.22 
 
 
292 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  82.82 
 
 
292 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  82.82 
 
 
292 aa  518  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  83.16 
 
 
292 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  82.13 
 
 
292 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  81.16 
 
 
292 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  76.9 
 
 
292 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  76.9 
 
 
292 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  77.24 
 
 
292 aa  477  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  76.9 
 
 
292 aa  475  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  76.55 
 
 
292 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  76.55 
 
 
292 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  77.24 
 
 
292 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  77.59 
 
 
292 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  76.55 
 
 
292 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  76.55 
 
 
292 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  77.24 
 
 
292 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  76.21 
 
 
292 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  77.24 
 
 
292 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  77.24 
 
 
292 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  74.14 
 
 
292 aa  458  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  66.9 
 
 
296 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  65.52 
 
 
292 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  64.48 
 
 
302 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  61.81 
 
 
292 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  59.52 
 
 
297 aa  362  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  55.82 
 
 
293 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  48.8 
 
 
281 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  46.02 
 
 
286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  46.08 
 
 
289 aa  267  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  47.49 
 
 
297 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  46.9 
 
 
286 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  46.23 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  48.11 
 
 
296 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  47.99 
 
 
297 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  48.11 
 
 
296 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  47.65 
 
 
297 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  47.12 
 
 
289 aa  262  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  46.67 
 
 
297 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  48.29 
 
 
289 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  48.14 
 
 
305 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  46.76 
 
 
291 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  48.79 
 
 
278 aa  257  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  47.6 
 
 
289 aa  255  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  45.3 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  44.67 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  47.62 
 
 
292 aa  251  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  47.62 
 
 
292 aa  251  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  43.97 
 
 
313 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  43.64 
 
 
300 aa  233  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  42 
 
 
295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  42 
 
 
295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  42 
 
 
295 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  42 
 
 
295 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  42 
 
 
295 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  42 
 
 
295 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  42 
 
 
295 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  42 
 
 
295 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  40.67 
 
 
300 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  40.67 
 
 
300 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  41.5 
 
 
312 aa  221  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  42.03 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  39.26 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  39.04 
 
 
294 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  39.04 
 
 
294 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  42.37 
 
 
297 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  39.04 
 
 
294 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  39.73 
 
 
294 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  39.93 
 
 
294 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  40.07 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  37.16 
 
 
306 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  37.46 
 
 
317 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  33.44 
 
 
309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  31.11 
 
 
306 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  32.55 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  35.45 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  32.3 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  31.35 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  35.06 
 
 
302 aa  129  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  31.91 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  32.81 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  35.21 
 
 
299 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  31.77 
 
 
300 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  33.46 
 
 
298 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  33.2 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  33.2 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  30.42 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  30.8 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  30.11 
 
 
306 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  27.56 
 
 
848 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  28.34 
 
 
438 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  26.29 
 
 
836 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  27.5 
 
 
835 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  23.89 
 
 
467 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  23.11 
 
 
420 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  27.69 
 
 
454 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  25.91 
 
 
461 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  27.46 
 
 
828 aa  46.6  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>