145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4297 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  100 
 
 
299 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  50.87 
 
 
299 aa  278  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  48.61 
 
 
306 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  49.15 
 
 
302 aa  272  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  50.35 
 
 
306 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  48.8 
 
 
299 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  49.65 
 
 
306 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  47.75 
 
 
310 aa  261  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  47.62 
 
 
306 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  47.4 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  48.61 
 
 
306 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  46.94 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  45.17 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  52.21 
 
 
298 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  51.21 
 
 
298 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  41.02 
 
 
300 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  38.51 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  38.44 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  38.44 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  38.44 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  38.44 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  38.51 
 
 
295 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  38.51 
 
 
295 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  38.44 
 
 
295 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  37.93 
 
 
292 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  37.93 
 
 
292 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  35.91 
 
 
302 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  37.67 
 
 
300 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  37.67 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  37 
 
 
294 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  36.27 
 
 
304 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  37.11 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  37.11 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  36.86 
 
 
294 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  36.86 
 
 
294 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  38.91 
 
 
297 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  36.05 
 
 
297 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  34.6 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  35.71 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  32.31 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  35.81 
 
 
296 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  35.74 
 
 
306 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  35.47 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  35.91 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  35.57 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  39.12 
 
 
312 aa  162  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  35.57 
 
 
297 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  34.45 
 
 
300 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  36.3 
 
 
298 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  35.45 
 
 
297 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  36.09 
 
 
286 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  31.89 
 
 
289 aa  153  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  34.36 
 
 
285 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  36.68 
 
 
286 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  34.58 
 
 
291 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  35.41 
 
 
281 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  34.98 
 
 
278 aa  149  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  33.11 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  35.42 
 
 
292 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  32.99 
 
 
289 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  32.82 
 
 
292 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  34.44 
 
 
292 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  32.66 
 
 
305 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  33.83 
 
 
292 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  34.07 
 
 
292 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  34.07 
 
 
292 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  34.07 
 
 
292 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  34.07 
 
 
292 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  33.7 
 
 
292 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  33.7 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  33.7 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  33.7 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  32.66 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  35.09 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  35.09 
 
 
292 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  35.09 
 
 
292 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  32.96 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  35.58 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  32.96 
 
 
292 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  31.8 
 
 
297 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  33.09 
 
 
292 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  32.58 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  32.58 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  32.58 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  33.73 
 
 
296 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  33.58 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  30.39 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  33.73 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  33.96 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  33.93 
 
 
293 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  31.18 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  27.86 
 
 
423 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  35.8 
 
 
452 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3962  peptidase U32  37.04 
 
 
472 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  28.32 
 
 
440 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  40 
 
 
432 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  26.19 
 
 
419 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  35.8 
 
 
438 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  38.67 
 
 
453 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  38.46 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>