173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0827 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  100 
 
 
309 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  40.07 
 
 
302 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  40.27 
 
 
295 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  40.27 
 
 
295 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  40.27 
 
 
295 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  40.27 
 
 
295 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  40.27 
 
 
295 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  40.27 
 
 
295 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  40.27 
 
 
295 aa  235  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  40.27 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  39.66 
 
 
300 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  38.28 
 
 
300 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  38.28 
 
 
300 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  39.32 
 
 
299 aa  219  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  35.91 
 
 
294 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  36.33 
 
 
294 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  35.91 
 
 
294 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  35.23 
 
 
294 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  36.72 
 
 
297 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  36.96 
 
 
298 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  35.23 
 
 
294 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  37.42 
 
 
296 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  34.34 
 
 
306 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  35.93 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  37.42 
 
 
296 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  37.58 
 
 
292 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  37.58 
 
 
292 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  35.02 
 
 
310 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  34.8 
 
 
310 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  38.33 
 
 
297 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  37.18 
 
 
297 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  38.05 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  37 
 
 
297 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  38.38 
 
 
289 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  36.21 
 
 
306 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  37.09 
 
 
297 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  37.37 
 
 
289 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  37.09 
 
 
297 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  37.09 
 
 
297 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  34.33 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  35.45 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  34.23 
 
 
306 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  37.04 
 
 
305 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  35.2 
 
 
292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  37.92 
 
 
281 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  35.31 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  34.33 
 
 
289 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  35.33 
 
 
300 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  33.89 
 
 
306 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  34.45 
 
 
286 aa  175  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  33.22 
 
 
306 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  33.44 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  33.12 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  36.42 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  34.52 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  34.77 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  34.58 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  34.46 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  34.21 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  33.77 
 
 
286 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  33.22 
 
 
302 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  34.75 
 
 
292 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  33 
 
 
299 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  34 
 
 
312 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  35.86 
 
 
292 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  35.86 
 
 
292 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  35.86 
 
 
292 aa  169  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  35.41 
 
 
292 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  35.53 
 
 
292 aa  168  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  31.44 
 
 
306 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  36.18 
 
 
298 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  35.86 
 
 
292 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  35.53 
 
 
292 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  35.53 
 
 
292 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  35.53 
 
 
292 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  35.53 
 
 
292 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  35.86 
 
 
292 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  33.66 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  35.86 
 
 
298 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  35.2 
 
 
292 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  35.86 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  32.31 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  35.53 
 
 
292 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  35.53 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  35.53 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  34.43 
 
 
292 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  34.43 
 
 
292 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  34.43 
 
 
292 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  34.43 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  33.44 
 
 
292 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  34.1 
 
 
292 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  22.31 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  23.75 
 
 
418 aa  56.2  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  21.95 
 
 
767 aa  55.8  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  24.57 
 
 
838 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  22.87 
 
 
442 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  24.58 
 
 
405 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  22.3 
 
 
667 aa  52.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  25.55 
 
 
621 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  27.17 
 
 
672 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>