127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3613 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  100 
 
 		 292 aa  604  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  98.97 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  98.97 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  99.32 
 
 		 292 aa  599  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  98.97 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  98.97 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  98.97 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  98.97 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  98.97 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  92.81 
 
 		 292 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  92.12 
 
 		 292 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  92.12 
 
 		 292 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  92.47 
 
 		 292 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  91.78 
 
 		 292 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  89.73 
 
 		 292 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  78.62 
 
 		 292 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  77.24 
 
 		 292 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  76.21 
 
 		 292 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  76.9 
 
 		 292 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  76.9 
 
 		 292 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  75.52 
 
 		 292 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  75.52 
 
 		 292 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  75.52 
 
 		 292 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  64.6 
 
 		 292 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  64.6 
 
 		 296 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  63.92 
 
 		 302 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  62.54 
 
 		 292 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  59.72 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  57.19 
 
 		 293 aa  349  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  49.66 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  49.31 
 
 		 296 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  47.68 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  48.01 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  49.66 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  47.35 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  47.02 
 
 		 297 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  48.81 
 
 		 289 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  47.42 
 
 		 281 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  49.32 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  48.3 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  46.13 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  44.75 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  44.63 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  45.73 
 
 		 285 aa  258  8e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  45.33 
 
 		 286 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  45.55 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  45.55 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  43.1 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  46.23 
 
 		 286 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  42.58 
 
 		 313 aa  251  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  41.47 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  45.67 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  41.47 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  41.95 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  41.95 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  41.95 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  41.95 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  41.95 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  41.95 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  41.95 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  41.61 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  43.88 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  38.26 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  41.69 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  40.35 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  39.73 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  39.73 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  39.66 
 
 		 294 aa  212  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  38.78 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  40.2 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  38.7 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  39.93 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  38.57 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  35.18 
 
 		 317 aa  168  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  35.86 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  35.34 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  34.73 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  32.3 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  32.7 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  34.5 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  34.44 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  34.5 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  34.44 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  32.67 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  32.33 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  30.6 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  32.42 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  32.03 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  31 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  30.22 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  30.22 
 
 		 306 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  26.97 
 
 		 438 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  25.86 
 
 		 836 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  26.19 
 
 		 886 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  24.87 
 
 		 467 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  26.83 
 
 		 454 aa  45.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  25 
 
 		 462 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  26.05 
 
 		 838 aa  45.8  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  25.13 
 
 		 458 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  25.13 
 
 		 458 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>