158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0182 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  83.16 
 
 		 302 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  81.1 
 
 		 296 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  75.6 
 
 		 292 aa  474  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  66.67 
 
 		 292 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  66.67 
 
 		 292 aa  427  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  66.67 
 
 		 292 aa  427  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  65.64 
 
 		 292 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  65.29 
 
 		 292 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  65.29 
 
 		 292 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  64.83 
 
 		 292 aa  414  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  65.52 
 
 		 292 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  65.29 
 
 		 292 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  65.64 
 
 		 292 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  64.95 
 
 		 292 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  64.95 
 
 		 292 aa  411  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  65.29 
 
 		 292 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  65.29 
 
 		 292 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  64.95 
 
 		 292 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  64.95 
 
 		 292 aa  411  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  65.29 
 
 		 292 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  64.6 
 
 		 292 aa  411  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  64.6 
 
 		 292 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  63.45 
 
 		 292 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  62.5 
 
 		 292 aa  401  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  62.07 
 
 		 292 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  61.86 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  59.03 
 
 		 297 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  56.46 
 
 		 293 aa  352  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  50 
 
 		 286 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  51.9 
 
 		 286 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  49.83 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  50 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  47.47 
 
 		 291 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  46.41 
 
 		 313 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  47.16 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  48.11 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  47.42 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  47.42 
 
 		 305 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  45.86 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  47.49 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  46.02 
 
 		 296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  47.6 
 
 		 289 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  45.54 
 
 		 297 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  45.54 
 
 		 297 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  45.67 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  44.41 
 
 		 297 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  45.49 
 
 		 278 aa  255  6e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  43.1 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  41.41 
 
 		 298 aa  241  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  42.95 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  44.33 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  44.33 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  42.62 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  40.34 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  39.8 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  40.8 
 
 		 312 aa  224  9e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  38.87 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  38.72 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  38.87 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  38.87 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  38.72 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  38.87 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  39.04 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  39.04 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  38.87 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  38.38 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  38.41 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  41.44 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  40.48 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  38.14 
 
 		 294 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  38.14 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  38.36 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  35.95 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  33.66 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  36.43 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  34.55 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  36 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  35.48 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  36.58 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  34.01 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  33.86 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  33.77 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  33.6 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  33.21 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  35.86 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  33.86 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  34.66 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  35.86 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  34.26 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  33.63 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  27.12 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  29.83 
 
 		 462 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  24.57 
 
 		 435 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  28.18 
 
 		 458 aa  52.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  28.18 
 
 		 458 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  28.19 
 
 		 438 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  29.12 
 
 		 454 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  25.91 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  35.11 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>