95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1788 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  100 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  97.96 
 
 		 294 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  92.52 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  92.52 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  90.03 
 
 		 294 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  57.48 
 
 		 304 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  56.7 
 
 		 306 aa  329  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  55.29 
 
 		 302 aa  319  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  53.22 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  53.22 
 
 		 300 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  50 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  48.6 
 
 		 300 aa  288  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  49.66 
 
 		 295 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  46.74 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  51.7 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  44.98 
 
 		 292 aa  254  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  44.98 
 
 		 292 aa  254  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  44.52 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  45.99 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  42.56 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  45.02 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  44.14 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  44.03 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  43.69 
 
 		 297 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  43.14 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  43.69 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  41.98 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  44.06 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  43.1 
 
 		 305 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  42.71 
 
 		 289 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  43.1 
 
 		 289 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  42.01 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  42.16 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  40.89 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  41.24 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  43.69 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  42.91 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  40.56 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  38.06 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  38.78 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  39.19 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  38.14 
 
 		 292 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  41.56 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  40.07 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  38.23 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  38.23 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  38.23 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  39.38 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  39.38 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  39.04 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  39.04 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  38.7 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  38.7 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  38.7 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  38.7 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  39.04 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  37.33 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  35.23 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  39.04 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  38.7 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  38.7 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  38.7 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  38.7 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  38.85 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  38.36 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  36.73 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  37.33 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  36.95 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  36.3 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  36.03 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  37.58 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  37.71 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  36.91 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  36.86 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  37.2 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  37.45 
 
 		 306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  35.59 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  39.26 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  39.85 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  38.27 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  35.35 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  37.04 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  37.04 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  35.67 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  35.67 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  26.35 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  20.42 
 
 		 408 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  26.54 
 
 		 414 aa  45.8  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  28.34 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>