107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3583 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  100 
 
 
292 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  100 
 
 
292 aa  608  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  99.66 
 
 
292 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  82.82 
 
 
292 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  82.82 
 
 
292 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  81.51 
 
 
292 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  80.76 
 
 
292 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  79.38 
 
 
292 aa  507  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  75.86 
 
 
292 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  75.86 
 
 
292 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  75.86 
 
 
292 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  75.52 
 
 
292 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  75.86 
 
 
292 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  75.86 
 
 
292 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  75.86 
 
 
292 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  75.86 
 
 
292 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  75.52 
 
 
292 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  76.21 
 
 
292 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  75.86 
 
 
292 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  75.86 
 
 
292 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  75.86 
 
 
292 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  75.86 
 
 
292 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  72.76 
 
 
292 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  66.67 
 
 
292 aa  427  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  65.86 
 
 
302 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  65.52 
 
 
296 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  63.19 
 
 
292 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  60.21 
 
 
297 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  55.44 
 
 
293 aa  346  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  49.15 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  48.8 
 
 
281 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  47.1 
 
 
285 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  50.34 
 
 
289 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  49.33 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  48.48 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  48.82 
 
 
297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  48.47 
 
 
289 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  48.48 
 
 
297 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  48.15 
 
 
297 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  49.32 
 
 
289 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  48.97 
 
 
296 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  45.86 
 
 
286 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  48.62 
 
 
296 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  47.12 
 
 
291 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  44.56 
 
 
289 aa  265  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  46.74 
 
 
278 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  42.52 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  46.23 
 
 
292 aa  252  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  46.23 
 
 
292 aa  252  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  43.24 
 
 
297 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  41.69 
 
 
313 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  42.19 
 
 
300 aa  244  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  41.86 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  41.86 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  41.86 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  41.86 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  41.86 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  41.86 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  41.86 
 
 
300 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  41.53 
 
 
295 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  41.53 
 
 
295 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  39.6 
 
 
298 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  41.72 
 
 
300 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  42.37 
 
 
312 aa  221  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  40.55 
 
 
294 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  40.14 
 
 
300 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  42.03 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  39.12 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  39.12 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  38.23 
 
 
294 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  38.23 
 
 
294 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  40.75 
 
 
304 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  36.82 
 
 
306 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  35.35 
 
 
317 aa  168  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  34.43 
 
 
309 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  32.16 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  33.21 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  37.05 
 
 
299 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  31.46 
 
 
299 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  31.37 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  32.09 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  30.1 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  34.33 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  32.66 
 
 
299 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  30.98 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  31.56 
 
 
306 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  30.42 
 
 
306 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  31.3 
 
 
298 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  31.56 
 
 
306 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  28.76 
 
 
298 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  28.76 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  27.05 
 
 
696 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  23.17 
 
 
836 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  32.84 
 
 
826 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  26.6 
 
 
438 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  27.87 
 
 
467 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  25.91 
 
 
828 aa  45.8  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  26.39 
 
 
838 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  22.75 
 
 
886 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  25.81 
 
 
455 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>