105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0997 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  100 
 
 		 278 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  64.34 
 
 		 286 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  61.72 
 
 		 289 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  60.69 
 
 		 291 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  60.35 
 
 		 285 aa  360  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  59.93 
 
 		 289 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  61.81 
 
 		 289 aa  358  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  62.87 
 
 		 281 aa  358  6e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  61.48 
 
 		 286 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  61.25 
 
 		 305 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  60.69 
 
 		 289 aa  353  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  60.75 
 
 		 297 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  60.07 
 
 		 297 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  59.73 
 
 		 297 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  60.07 
 
 		 297 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  53.59 
 
 		 313 aa  322  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  47.12 
 
 		 302 aa  271  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  48.42 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  50.17 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  47.4 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  48.79 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  47.22 
 
 		 296 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  46.74 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  46.74 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  46.74 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  45.49 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  47.06 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  44.33 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  44.48 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  46.18 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  44.83 
 
 		 296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  47.4 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  46.37 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  46.37 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  46.37 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  46.37 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  46.02 
 
 		 292 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  46.02 
 
 		 292 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  46.02 
 
 		 292 aa  244  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  46.02 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  45.67 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  46.02 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  46.02 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  45.67 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  45.67 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  45.67 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  44.22 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  44.22 
 
 		 300 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  44.64 
 
 		 292 aa  238  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  43.2 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  41.44 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  40.94 
 
 		 295 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  43.25 
 
 		 292 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  43.25 
 
 		 292 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  43 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  41.1 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  40.67 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  40.67 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  41.96 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  40.67 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  40.67 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  40.67 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  40.67 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  40.67 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  40.56 
 
 		 294 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  40.91 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  40.91 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  41.81 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  40.56 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  40.2 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  41.14 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  38.49 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  41.03 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  42.58 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  35.45 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  38.37 
 
 		 306 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  39.22 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  37.04 
 
 		 310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  36.33 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  36.63 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  35.08 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  37.61 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  39.68 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  37.4 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  38.46 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  34.27 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  38.46 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  35.2 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  33.47 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  33.2 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  32.66 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  27.33 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  25.16 
 
 		 790 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  27.52 
 
 		 792 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  22.8 
 
 		 408 aa  45.8  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  28.74 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  26.7 
 
 		 454 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  24.82 
 
 		 413 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  32.98 
 
 		 423 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  26.79 
 
 		 442 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>