104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02300 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  91.16 
 
 		 294 aa  547  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  91.16 
 
 		 294 aa  547  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  90.72 
 
 		 294 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  90.03 
 
 		 294 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  58.28 
 
 		 304 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  57.39 
 
 		 306 aa  338  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  52.53 
 
 		 300 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  52.53 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  53.22 
 
 		 302 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  50 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  50.17 
 
 		 295 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  49.83 
 
 		 295 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  47.42 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  52.67 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  46.18 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  46.18 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  48.63 
 
 		 298 aa  262  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  47.02 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  45.67 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  45.33 
 
 		 289 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  43.15 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  44.98 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  45.24 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  44.9 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  44.9 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  44.56 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  44.76 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  43.94 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  44.29 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  45.45 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  42.96 
 
 		 296 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  41.11 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  41.92 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  44.44 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  41.81 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  41.96 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  43.14 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  37.72 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  41.67 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  38.41 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  38.44 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  40.34 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  38.85 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  40.55 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  40.55 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  40.55 
 
 		 292 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  40 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  40 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  39.66 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  40 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  39.66 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  39.66 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  39.66 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  39.66 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  39.66 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  40.34 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  39.87 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  40.34 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  36.33 
 
 		 309 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  39.18 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  40 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  40 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  40 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  40.68 
 
 		 292 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  39.73 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  37.93 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  38.23 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  37.93 
 
 		 292 aa  202  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  38.85 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  36.75 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  37.21 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  36.88 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  37 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  33.9 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  37.71 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  41.31 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  36.36 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  35 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  37.58 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  37.8 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  38.41 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  33.33 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  35.69 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  35.69 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  21.99 
 
 		 408 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  27.66 
 
 		 442 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  22.73 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  24.68 
 
 		 426 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  21.43 
 
 		 411 aa  45.8  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  26.59 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  20.62 
 
 		 406 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  27.46 
 
 		 656 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  26.52 
 
 		 438 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>