173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1004 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  100 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  84.97 
 
 		 306 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  84.64 
 
 		 306 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  75.42 
 
 		 306 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  57.34 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  57.34 
 
 		 310 aa  342  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  55.63 
 
 		 306 aa  338  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  49.49 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  48.61 
 
 		 299 aa  265  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  48.04 
 
 		 298 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  46.88 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  48.04 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  46.8 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  42.71 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  43.33 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  40 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  36.55 
 
 		 295 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  36.73 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  36.9 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  36.73 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  36.73 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  36.9 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  36.73 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  36.55 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  36.21 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  36.91 
 
 		 302 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  34.58 
 
 		 300 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  34.58 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  37.38 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  37.9 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  32.43 
 
 		 292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  32.43 
 
 		 292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  34.13 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  37.04 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  37.04 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  32.78 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  37.04 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  37.04 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  34.04 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  32.54 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  32.08 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  30.85 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  37.25 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  31.1 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  30.41 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  31.19 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  30.17 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  31.19 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  32.42 
 
 		 285 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  33.56 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  31.88 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  30.43 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  30.94 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  30.51 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  31.27 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  31.03 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  33.86 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  29.49 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  31.3 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  33.2 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  31.6 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  32 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  29.49 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  30.08 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  31.56 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  31.56 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  30.42 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  31.56 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  32.27 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  30.42 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  30.48 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  30.8 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  26.54 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  32 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  30.63 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  30.22 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  30.63 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  30.04 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  30.63 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  30.26 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  30.26 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  30.26 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  30.26 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  29.85 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  30.65 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  28.88 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  29.1 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  29.1 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  29.1 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  29.1 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2234  hypothetical protein  28.92 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00649369  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  26.37 
 
 		 439 aa  58.9  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  30.97 
 
 		 810 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  25.96 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1205  peptidase U32  28.21 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  25.4 
 
 		 767 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  23.46 
 
 		 783 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  26.78 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3095  U32 family peptidase  34.04 
 
 		 449 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>