108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2388 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  99.32 
 
 
295 aa  607  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  99.32 
 
 
295 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  99.32 
 
 
295 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  96.95 
 
 
295 aa  594  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  63.27 
 
 
300 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  62.93 
 
 
300 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  59.32 
 
 
302 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  52.54 
 
 
298 aa  322  6e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  58.31 
 
 
297 aa  308  8e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  52.56 
 
 
304 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  50.34 
 
 
294 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  50.34 
 
 
294 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  50.68 
 
 
294 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  50 
 
 
294 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  50.17 
 
 
294 aa  288  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  46.74 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  48.97 
 
 
292 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  48.97 
 
 
292 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  48.81 
 
 
306 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  43.92 
 
 
285 aa  259  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  42.81 
 
 
297 aa  258  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  44.71 
 
 
281 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  47.18 
 
 
312 aa  255  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  46.13 
 
 
296 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  45.3 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  42.76 
 
 
297 aa  249  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  41.08 
 
 
286 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  42.42 
 
 
292 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  39.66 
 
 
286 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  44.33 
 
 
292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  42.76 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  44.33 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  46.46 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  41.86 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  41.86 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  41.86 
 
 
292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  41.95 
 
 
293 aa  242  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  43.1 
 
 
289 aa  242  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  42.42 
 
 
305 aa  241  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  42.16 
 
 
292 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  41.78 
 
 
297 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  41.44 
 
 
297 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  41 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  41.95 
 
 
292 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  41.95 
 
 
292 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  41.95 
 
 
292 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  41.95 
 
 
292 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  41.95 
 
 
292 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  42.09 
 
 
289 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  41.1 
 
 
297 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  41.28 
 
 
296 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  41.95 
 
 
292 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  41.61 
 
 
292 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  41.95 
 
 
292 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  41.95 
 
 
292 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  40.6 
 
 
302 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  41.22 
 
 
289 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  43.69 
 
 
317 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  42.62 
 
 
292 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  40.75 
 
 
297 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  40.27 
 
 
309 aa  235  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  41.78 
 
 
291 aa  235  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  42.28 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  41.95 
 
 
292 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  41.95 
 
 
292 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  42 
 
 
292 aa  232  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  41.2 
 
 
292 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  40.66 
 
 
313 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  40.6 
 
 
292 aa  228  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  40.67 
 
 
278 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  38.87 
 
 
292 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  37.24 
 
 
306 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  39.25 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  38.44 
 
 
299 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  36.73 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  36.73 
 
 
306 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  35.37 
 
 
306 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  38.01 
 
 
300 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  37.04 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  37.33 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  36.7 
 
 
310 aa  179  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  35.14 
 
 
306 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  35.49 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  37.58 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  34.68 
 
 
298 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  34.9 
 
 
298 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  34.9 
 
 
298 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  28.65 
 
 
442 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  28.65 
 
 
471 aa  59.3  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  29.41 
 
 
418 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  26.13 
 
 
838 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  20.94 
 
 
411 aa  46.2  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  26.16 
 
 
839 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  22.32 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  23.78 
 
 
747 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2078  peptidase U32  23.78 
 
 
746 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.292848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>