173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3203 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  100 
 
 
297 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  97.98 
 
 
297 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  97.64 
 
 
297 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  97.64 
 
 
297 aa  607  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  82.13 
 
 
289 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  81.79 
 
 
289 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  80.27 
 
 
291 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  81.1 
 
 
305 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  80.2 
 
 
289 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  62.67 
 
 
286 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  63.7 
 
 
286 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  62.93 
 
 
285 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  60.82 
 
 
289 aa  371  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  61.02 
 
 
281 aa  362  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  57.47 
 
 
313 aa  361  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  60.07 
 
 
278 aa  348  7e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  47.16 
 
 
292 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  47 
 
 
292 aa  278  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  47.52 
 
 
296 aa  278  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  46.49 
 
 
302 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  48.48 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  48.48 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  48.48 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  47.68 
 
 
292 aa  273  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  47.68 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  47.68 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  47.68 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  47.35 
 
 
292 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  47.49 
 
 
292 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  47.02 
 
 
292 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  48.66 
 
 
292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  47.02 
 
 
292 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  47.02 
 
 
292 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  47.68 
 
 
292 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  47.02 
 
 
292 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  48.03 
 
 
292 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  47.49 
 
 
292 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  47.7 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  47.7 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  47.35 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  47.32 
 
 
292 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  46.13 
 
 
297 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  46.51 
 
 
292 aa  261  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  47.32 
 
 
292 aa  261  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  44.48 
 
 
302 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  43.33 
 
 
293 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  44.41 
 
 
297 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  44.56 
 
 
294 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  44.63 
 
 
294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  45.36 
 
 
294 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  45.36 
 
 
294 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  41.1 
 
 
295 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  44.15 
 
 
304 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  43.14 
 
 
294 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  40.75 
 
 
295 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  40.75 
 
 
295 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  40.75 
 
 
295 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  40.75 
 
 
295 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  40.75 
 
 
295 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  40.75 
 
 
295 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  40.75 
 
 
295 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  41.64 
 
 
300 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  41.64 
 
 
300 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  40.61 
 
 
300 aa  228  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  40.75 
 
 
292 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  40.75 
 
 
292 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  40.74 
 
 
296 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  41.08 
 
 
296 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  43.1 
 
 
306 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  40.4 
 
 
300 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  42.09 
 
 
312 aa  216  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  41.75 
 
 
298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  40.41 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  37.09 
 
 
309 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  37.21 
 
 
317 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  36.18 
 
 
299 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  32.44 
 
 
306 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  34.92 
 
 
299 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  34.24 
 
 
299 aa  159  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  35.71 
 
 
310 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  30.58 
 
 
306 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  32.77 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  31.74 
 
 
306 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  30.85 
 
 
306 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  34.07 
 
 
296 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  34.9 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  34.24 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  30.38 
 
 
306 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  32.21 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  33.6 
 
 
298 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  33.2 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  24.28 
 
 
442 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  27.19 
 
 
435 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  33.71 
 
 
453 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  26.73 
 
 
434 aa  56.6  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  34.95 
 
 
423 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2206  U32 family peptidase  29.13 
 
 
426 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10791  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  29.13 
 
 
444 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  26.86 
 
 
438 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  30.39 
 
 
476 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>