More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5510 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
331 aa  662    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.308853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3510  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  45.62 
 
 
329 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1849  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  46.31 
 
 
338 aa  292  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.06 
 
 
332 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.764925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 
336 aa  285  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00484259  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5912  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.07 
 
 
339 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 
337 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113735  normal  0.0248138 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.74 
 
 
331 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0713314  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1820  putative peptide transport system permease protein  40.18 
 
 
337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.756462  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
338 aa  265  8e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.38 
 
 
352 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000389159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
329 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.29 
 
 
331 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24250  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  46.13 
 
 
360 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
337 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0277436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
322 aa  245  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0437  putative dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  40.84 
 
 
398 aa  237  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.236765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00720  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.83 
 
 
350 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5632  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  37.39 
 
 
323 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
332 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
317 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
306 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2126  permease of oligopeptide ABC transporter  37.31 
 
 
322 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689905  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.08 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
306 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  33.54 
 
 
306 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
306 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
314 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
306 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  35.16 
 
 
339 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
306 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
313 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  34.48 
 
 
336 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
336 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
336 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  35.06 
 
 
336 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
313 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  35.06 
 
 
336 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.34 
 
 
336 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.21 
 
 
336 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  35.34 
 
 
336 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  35.34 
 
 
336 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  35.34 
 
 
336 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  36.5 
 
 
327 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  35.34 
 
 
336 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
309 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  35.34 
 
 
336 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 
336 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  35.34 
 
 
336 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
336 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  35.06 
 
 
336 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  34.38 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
336 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.77 
 
 
336 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  35.06 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
313 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
320 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  34.47 
 
 
339 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  34.47 
 
 
339 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  34.47 
 
 
339 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  34.47 
 
 
381 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  34.47 
 
 
339 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  34.47 
 
 
339 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  34.47 
 
 
339 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  34.47 
 
 
339 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  36 
 
 
336 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
306 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  34.47 
 
 
339 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  34.95 
 
 
317 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
305 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  normal  0.480947 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  33.05 
 
 
339 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  33.62 
 
 
351 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  33.05 
 
 
339 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
305 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
305 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
317 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  35.92 
 
 
336 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 
336 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  35.92 
 
 
336 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.95 
 
 
321 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  34.19 
 
 
339 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  34.19 
 
 
339 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  34.19 
 
 
339 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  34.19 
 
 
339 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  34.19 
 
 
339 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  34.57 
 
 
336 aa  185  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  33.33 
 
 
339 aa  185  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  33.05 
 
 
339 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>