More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1849 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1849  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  100 
 
 		 338 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5912  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  71.98 
 
 		 339 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1820  putative peptide transport system permease protein  59.52 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.756462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.42 
 
 		 352 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000389159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.51 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00484259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.24 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113735  normal  0.0248138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.42 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0277436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3510  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  49.4 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.308853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.51 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.764925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.18 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.43 
 
 		 329 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236765 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0437  putative dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  40.94 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 		 322 aa  245  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24250  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  45.43 
 
 		 360 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2126  permease of oligopeptide ABC transporter  43.73 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5632  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.23 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18926  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  40.36 
 
 		 314 aa  228  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.71 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0713314  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  37.15 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 		 306 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.735506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  36.87 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  36.87 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  36.87 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  36.87 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  36.87 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  36.87 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  36.87 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  36.87 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  36.87 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  36.59 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  36.59 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  36.59 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  36.59 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  36.31 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  36.59 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.87 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  36.34 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  36.59 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  41.44 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 		 317 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  35.75 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  35.75 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  39.55 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  36.31 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.11 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  36.31 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.5 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  35.47 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  37.25 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  36.06 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  36.62 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  36.62 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  36.34 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  35.49 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  38.55 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  36.69 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  36.69 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.55 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  36.44 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 		 335 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  40.12 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  35.85 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.37 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 		 321 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.65 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  40.61 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  40.61 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  40.61 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.61 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 		 313 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 		 317 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>