More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5912 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5912  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
339 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1849  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  71.98 
 
 
338 aa  478  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.24 
 
 
352 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000389159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1820  putative peptide transport system permease protein  57.77 
 
 
337 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.756462  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.73 
 
 
337 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113735  normal  0.0248138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.28 
 
 
336 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00484259  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.82 
 
 
337 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0277436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3510  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  49.12 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.308853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
332 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.764925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 
324 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 
332 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
329 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.19 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
322 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0437  putative dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  42.27 
 
 
398 aa  245  9e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24250  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  46.71 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
320 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.236765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2126  permease of oligopeptide ABC transporter  44.19 
 
 
322 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689905  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5632  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.94 
 
 
323 aa  228  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
334 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  37.29 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
312 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
316 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.03 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0713314  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.03 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
313 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
306 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  36.72 
 
 
336 aa  208  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
306 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
334 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
317 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
317 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
309 aa  205  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  38.98 
 
 
336 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  38.7 
 
 
336 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
333 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  38.98 
 
 
336 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.58 
 
 
314 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  38.42 
 
 
336 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  35.93 
 
 
339 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
308 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
335 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  38.14 
 
 
336 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  39.15 
 
 
336 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  35.85 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  39.15 
 
 
336 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
306 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  39.39 
 
 
337 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
336 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  39.15 
 
 
336 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.2 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  38.87 
 
 
336 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
336 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
336 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
326 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467018  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
308 aa  199  6e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.59 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  35.46 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.29 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  34.45 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  34.45 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  37.29 
 
 
336 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
313 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
361 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 
315 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.31 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.91 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
306 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
313 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  35.47 
 
 
351 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.31 
 
 
336 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
321 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  37.36 
 
 
336 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
335 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
306 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  38.59 
 
 
336 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
306 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  34.63 
 
 
381 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  34.63 
 
 
339 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  34.63 
 
 
339 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  35.2 
 
 
339 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  34.63 
 
 
339 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  34.63 
 
 
339 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  34.63 
 
 
339 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  34.63 
 
 
339 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  34.63 
 
 
339 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  34.63 
 
 
339 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  34.63 
 
 
339 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  34.63 
 
 
339 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  34.63 
 
 
339 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  34.63 
 
 
339 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>