More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  100 
 
 
331 aa  662    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0713314  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.308853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3510  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  42.55 
 
 
329 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.764925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
337 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113735  normal  0.0248138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
352 aa  225  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000389159  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0437  putative dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  36.42 
 
 
398 aa  223  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1849  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.71 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1820  putative peptide transport system permease protein  37.2 
 
 
337 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.756462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5912  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.03 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00484259  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24250  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.94 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
338 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
324 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
322 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0277436 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00720  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.09 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.31 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
313 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
316 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
321 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
313 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
321 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
320 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.236765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
306 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
313 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
308 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.23 
 
 
333 aa  175  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.14 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
321 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2126  permease of oligopeptide ABC transporter  35.21 
 
 
322 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689905  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
324 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 
321 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
313 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
306 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  33.81 
 
 
339 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  33.81 
 
 
339 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  33.81 
 
 
339 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  33.81 
 
 
339 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  33.62 
 
 
339 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  33.24 
 
 
339 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  33.24 
 
 
339 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  33.24 
 
 
339 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  33.24 
 
 
339 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.52 
 
 
320 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  33.24 
 
 
339 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  33.24 
 
 
339 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  33.24 
 
 
381 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  33.24 
 
 
339 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  33.24 
 
 
339 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
309 aa  169  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
306 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
313 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
313 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  35.02 
 
 
298 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  32.67 
 
 
339 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
322 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
321 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
322 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
322 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
319 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.37 
 
 
314 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5632  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.83 
 
 
323 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18926  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  33.43 
 
 
339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  32.39 
 
 
339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  32.39 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  32.58 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  32.86 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  33.9 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
332 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  32.01 
 
 
339 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
313 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  32.01 
 
 
339 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
336 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  33.03 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  33.05 
 
 
336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 
306 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  33.05 
 
 
336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
336 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  33.43 
 
 
306 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  33.43 
 
 
306 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.24 
 
 
313 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
308 aa  162  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
318 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>