More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3510 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3510  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  100 
 
 
329 aa  654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.15 
 
 
332 aa  341  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.764925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.25 
 
 
352 aa  335  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000389159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1820  putative peptide transport system permease protein  48.81 
 
 
337 aa  318  6e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.756462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.94 
 
 
329 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.61 
 
 
331 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5912  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.12 
 
 
339 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.4 
 
 
336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00484259  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.95 
 
 
337 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113735  normal  0.0248138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1849  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  49.4 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.35 
 
 
337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0277436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.53 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.9 
 
 
331 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.308853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24250  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  51.14 
 
 
360 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
322 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.55 
 
 
331 aa  269  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0713314  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0437  putative dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  43.5 
 
 
398 aa  260  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
338 aa  258  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508813  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5632  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  42.39 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00720  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.41 
 
 
350 aa  245  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
313 aa  238  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
320 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.236765 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.76 
 
 
306 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
306 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
306 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
306 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2126  permease of oligopeptide ABC transporter  41.67 
 
 
322 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689905  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
313 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
317 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.91 
 
 
324 aa  221  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  36.7 
 
 
313 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
313 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
306 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
313 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
316 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  35.06 
 
 
313 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
315 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
334 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
313 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
313 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
313 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.59 
 
 
313 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
306 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
320 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  37.3 
 
 
298 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
317 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  38.27 
 
 
317 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  37.39 
 
 
307 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
308 aa  206  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.77 
 
 
313 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
334 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
313 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  34.56 
 
 
339 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
309 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  34.28 
 
 
339 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  34.28 
 
 
339 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  34.28 
 
 
339 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  34.28 
 
 
339 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
316 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
321 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
306 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  33.99 
 
 
339 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
311 aa  202  6e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  33.14 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  34.45 
 
 
314 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
313 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  32.29 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  33.71 
 
 
339 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  33.71 
 
 
339 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  33.71 
 
 
339 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  33.71 
 
 
339 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  33.71 
 
 
339 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  33.71 
 
 
339 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  33.71 
 
 
339 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  33.71 
 
 
339 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
306 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
316 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
306 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  33.71 
 
 
381 aa  199  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  32.58 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
322 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
322 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  32.58 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
322 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  32.51 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  37.31 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.37 
 
 
306 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>