More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1290 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
336 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00484259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.35 
 
 
352 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000389159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1820  putative peptide transport system permease protein  57.14 
 
 
337 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.756462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5912  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.28 
 
 
339 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1849  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  56.51 
 
 
338 aa  358  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.19 
 
 
337 aa  355  8.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113735  normal  0.0248138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.74 
 
 
337 aa  339  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0277436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3510  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  49.4 
 
 
329 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 
332 aa  291  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 
332 aa  285  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.764925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 
329 aa  282  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.77 
 
 
331 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 
331 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.308853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0437  putative dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  42.86 
 
 
398 aa  257  2e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24250  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  48.25 
 
 
360 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 
338 aa  252  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
322 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.236765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2126  permease of oligopeptide ABC transporter  42.65 
 
 
322 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689905  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5632  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.66 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
317 aa  222  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.01 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.09 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0713314  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.9 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
308 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
309 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
317 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  36.44 
 
 
339 aa  205  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  39.76 
 
 
317 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
306 aa  205  9e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
306 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
312 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00720  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.55 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
315 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.52 
 
 
333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
314 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  36.23 
 
 
313 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
313 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.48 
 
 
324 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  38.97 
 
 
306 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  38.97 
 
 
306 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  38.97 
 
 
306 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  38.97 
 
 
306 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.72 
 
 
306 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 
306 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
306 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
318 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
313 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
321 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  33.63 
 
 
316 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  33.63 
 
 
316 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
306 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
316 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
316 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
316 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
306 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.63 
 
 
313 aa  192  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  34.73 
 
 
313 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.23 
 
 
315 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  36.84 
 
 
327 aa  192  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
321 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
313 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
314 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
306 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
306 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
315 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
313 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
334 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
334 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.61 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  36.59 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
321 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  34.75 
 
 
336 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  34.37 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  34.63 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 
316 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 
316 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
319 aa  189  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  33.04 
 
 
316 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
313 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.04 
 
 
316 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
313 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  33.62 
 
 
336 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
311 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  34.46 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  34.33 
 
 
306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
319 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.692549  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  34.33 
 
 
306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
319 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
306 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  34.33 
 
 
306 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>