292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0591 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0591  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
314 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0973  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.99 
 
 
304 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224221  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0851  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65.38 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1234  hypothetical protein  63.16 
 
 
304 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2696  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.31 
 
 
312 aa  318  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1426  diheme class I cytochrome c  52.1 
 
 
296 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2784  diheme class I cytochrome c  51.13 
 
 
296 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2228  diheme cytochrome c-type  46.86 
 
 
299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2869  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  52.99 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1042  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.2 
 
 
296 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983862  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5605  diheme cytochrome c-type  45.63 
 
 
306 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.388833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1441  putative diheme cytochrome c-553  46.41 
 
 
310 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1626  putative diheme cytochrome c-553  46.28 
 
 
306 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4495  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.39 
 
 
309 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5830  putative diheme cytochrome c-type signal-peptide protein  43.67 
 
 
306 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1615  putative diheme cytochrome c-553  44.67 
 
 
305 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706101  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1143  hypothetical protein  47.25 
 
 
532 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0240878  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4272  hypothetical protein  42.81 
 
 
545 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5232  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.46 
 
 
358 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.291205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1162  cytochrome c  40.79 
 
 
295 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.460761  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.88 
 
 
308 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.82 
 
 
1253 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1295  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.55 
 
 
278 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  34.65 
 
 
424 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  35.05 
 
 
420 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.94 
 
 
1182 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  37.78 
 
 
1183 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  34.94 
 
 
467 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2479  cytochrome c family protein  35.69 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  36.16 
 
 
976 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.54 
 
 
795 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  34.08 
 
 
1215 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  36.43 
 
 
806 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  36.43 
 
 
806 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  35.82 
 
 
975 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  39.21 
 
 
527 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  39.21 
 
 
527 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.53 
 
 
432 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.03 
 
 
831 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  37.17 
 
 
419 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.23 
 
 
444 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.3 
 
 
537 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.89 
 
 
996 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  36.67 
 
 
430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  36.67 
 
 
430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  36.67 
 
 
430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4060  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.85 
 
 
305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3784  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.85 
 
 
305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.911247  normal  0.572896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.59 
 
 
443 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  30.97 
 
 
424 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  35.53 
 
 
1202 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  34.08 
 
 
1181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  32.7 
 
 
429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.56 
 
 
447 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.49 
 
 
527 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.69 
 
 
689 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  33.21 
 
 
428 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  33.21 
 
 
428 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  32.92 
 
 
424 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  32.12 
 
 
427 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.61 
 
 
424 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.44 
 
 
1207 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  35.27 
 
 
698 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.7 
 
 
425 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.84 
 
 
426 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  35.56 
 
 
430 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.84 
 
 
428 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  32.84 
 
 
426 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  37.96 
 
 
554 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  35.07 
 
 
1187 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.21 
 
 
1191 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.79 
 
 
432 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.96 
 
 
530 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.78 
 
 
450 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  35.07 
 
 
1187 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.44 
 
 
433 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.7 
 
 
1187 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.29 
 
 
1179 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.66 
 
 
474 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.04 
 
 
429 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  34.7 
 
 
1187 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.87 
 
 
411 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  34.07 
 
 
421 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  32.48 
 
 
432 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.96 
 
 
680 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  34.41 
 
 
433 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.47 
 
 
538 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  34.8 
 
 
691 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  32.36 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  32.73 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.61 
 
 
442 aa  153  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.28 
 
 
440 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  33.02 
 
 
432 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  34.07 
 
 
468 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1417  cytochrome c, class I  34.83 
 
 
421 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00268752  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.32 
 
 
420 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.7 
 
 
418 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1130  putative cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  35.14 
 
 
484 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.13 
 
 
466 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.8 
 
 
434 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>