296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1441 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1441  putative diheme cytochrome c-553  100 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1626  putative diheme cytochrome c-553  77.63 
 
 		 306 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1615  putative diheme cytochrome c-553  77 
 
 		 305 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5605  diheme cytochrome c-type  70.07 
 
 		 306 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4495  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  73.26 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1143  hypothetical protein  52.38 
 
 		 532 aa  311  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0240878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4272  hypothetical protein  50.31 
 
 		 545 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0973  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.86 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5830  putative diheme cytochrome c-type signal-peptide protein  52.49 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0851  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.38 
 
 		 304 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1234  hypothetical protein  54.02 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5232  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.49 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0591  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.28 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2696  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.04 
 
 		 312 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1426  diheme class I cytochrome c  49.5 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2784  diheme class I cytochrome c  48.83 
 
 		 296 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2869  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  53.08 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2228  diheme cytochrome c-type  44.22 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1042  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1162  cytochrome c  44.85 
 
 		 295 aa  222  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.460761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.71 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1295  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.15 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  39.65 
 
 		 467 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.23 
 
 		 461 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.73 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  39.87 
 
 		 420 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.3 
 
 		 474 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  40.6 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  42.8 
 
 		 419 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.07 
 
 		 444 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.09 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  42.48 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.23 
 
 		 432 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.92 
 
 		 432 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  39.92 
 
 		 432 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.86 
 
 		 1253 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.86 
 
 		 1191 aa  198  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  39.53 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  36.54 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  41.09 
 
 		 430 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.58 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.38 
 
 		 443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  41.09 
 
 		 430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  41.09 
 
 		 430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  39.06 
 
 		 1187 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2479  cytochrome c family protein  39.26 
 
 		 407 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.15 
 
 		 469 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.15 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  39.15 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  39.15 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  36.66 
 
 		 424 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.75 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  40.43 
 
 		 421 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  39.04 
 
 		 1187 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.15 
 
 		 432 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  39.92 
 
 		 430 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  35.6 
 
 		 429 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.99 
 
 		 689 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  39.15 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  39.15 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  39.15 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  39.15 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  39.15 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  39.15 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  39.15 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  39.53 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  41.86 
 
 		 975 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  39.15 
 
 		 432 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 437 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.91 
 
 		 434 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.66 
 
 		 434 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.18 
 
 		 441 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  40.66 
 
 		 434 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  40.66 
 
 		 434 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  38.73 
 
 		 1187 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.15 
 
 		 432 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  40.22 
 
 		 432 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.7 
 
 		 831 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  41.41 
 
 		 806 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  41.41 
 
 		 806 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  40.66 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.19 
 
 		 996 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  37.91 
 
 		 1215 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.92 
 
 		 447 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.02 
 
 		 795 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.82 
 
 		 537 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.46 
 
 		 1187 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  42.91 
 
 		 527 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.17 
 
 		 531 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  42.91 
 
 		 527 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.52 
 
 		 531 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.44 
 
 		 434 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.41 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 712 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.31 
 
 		 538 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 432 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  39.22 
 
 		 424 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.42 
 
 		 432 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 432 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>