295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0851 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0851  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0973  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  94.74 
 
 		 304 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0591  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65.38 
 
 		 314 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1234  hypothetical protein  67.38 
 
 		 304 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2696  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  56.03 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1426  diheme class I cytochrome c  51.35 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5605  diheme cytochrome c-type  50.5 
 
 		 306 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1042  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  56.92 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2784  diheme class I cytochrome c  51.01 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1441  putative diheme cytochrome c-553  51.21 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1626  putative diheme cytochrome c-553  49.34 
 
 		 306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4495  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.79 
 
 		 309 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2869  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  53.51 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2228  diheme cytochrome c-type  46.74 
 
 		 299 aa  275  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1615  putative diheme cytochrome c-553  49.29 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5830  putative diheme cytochrome c-type signal-peptide protein  48.66 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4272  hypothetical protein  43.61 
 
 		 545 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1143  hypothetical protein  42.67 
 
 		 532 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0240878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5232  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.28 
 
 		 358 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1162  cytochrome c  45.56 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.460761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.63 
 
 		 308 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.58 
 
 		 1182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.91 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  40.31 
 
 		 975 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1295  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.47 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 467 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.51 
 
 		 429 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  42.21 
 
 		 420 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.69 
 
 		 831 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.3 
 
 		 795 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  39.3 
 
 		 806 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.95 
 
 		 996 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  39.3 
 
 		 806 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.7 
 
 		 1253 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2479  cytochrome c family protein  37.69 
 
 		 407 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 		 1183 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  39.92 
 
 		 976 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  36.88 
 
 		 432 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.55 
 
 		 443 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  37.08 
 
 		 1187 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  38.06 
 
 		 1181 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.91 
 
 		 474 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  34.87 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  37.13 
 
 		 450 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.47 
 
 		 442 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  37.01 
 
 		 1215 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.38 
 
 		 498 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  36.7 
 
 		 1187 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1130  putative cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  37.9 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  33.44 
 
 		 429 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.4 
 
 		 411 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.07 
 
 		 531 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.92 
 
 		 425 aa  175  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.08 
 
 		 466 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  36.7 
 
 		 1187 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.85 
 
 		 433 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.96 
 
 		 1187 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  35.02 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.31 
 
 		 436 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.11 
 
 		 447 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.7 
 
 		 531 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.96 
 
 		 432 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.58 
 
 		 432 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  37.46 
 
 		 447 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.55 
 
 		 450 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1781  cytochrome c, class I  37.93 
 
 		 451 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4060  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.45 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3784  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.45 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.911247  normal  0.572896 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 432 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 531 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.53 
 
 		 447 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  37.6 
 
 		 419 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.07 
 
 		 461 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  35.08 
 
 		 436 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.08 
 
 		 436 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  35.08 
 
 		 436 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  35.36 
 
 		 424 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.92 
 
 		 461 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.22 
 
 		 680 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.83 
 
 		 451 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.77 
 
 		 432 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.29 
 
 		 432 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.12 
 
 		 424 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.01 
 
 		 575 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  32.69 
 
 		 424 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.5 
 
 		 434 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 527 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  33.97 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  33.44 
 
 		 468 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.5 
 
 		 1191 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 527 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  33.97 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  36.15 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  36.15 
 
 		 430 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  38.44 
 
 		 691 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  35.52 
 
 		 432 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  36.15 
 
 		 430 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  36.86 
 
 		 428 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.65 
 
 		 428 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  36.29 
 
 		 430 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>