More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0700 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  70.79 
 
 		 293 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  69.72 
 
 		 285 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  70.07 
 
 		 285 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  69.37 
 
 		 285 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  68.31 
 
 		 285 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  67.96 
 
 		 285 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  68.31 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  67.96 
 
 		 285 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  67.82 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  65.65 
 
 		 295 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  64.91 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  62.02 
 
 		 288 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  62.02 
 
 		 288 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  57.04 
 
 		 277 aa  323  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  46.38 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  45.26 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  46.89 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  45.71 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  43.21 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.49 
 
 		 282 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  41.81 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  42.38 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  40.5 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  40.42 
 
 		 298 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  39.15 
 
 		 285 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  42.07 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  36.84 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  40.07 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  39.01 
 
 		 284 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  38.95 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  40.61 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.36 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.58 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  41.45 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  35.62 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  35.86 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  35.79 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  37.59 
 
 		 294 aa  188  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  38.57 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  36.18 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  38.97 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  39.86 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  37.41 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  37.45 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  35.91 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  39.64 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  37.41 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  36.88 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  37.45 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  34.48 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  37.82 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  37.09 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  35.35 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  36.1 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  33.44 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  35.14 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  33.56 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  35.59 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  34.86 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  34.69 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  38.52 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  35.93 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  37.46 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  38.33 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  38.13 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  35.48 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.96 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  38.65 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  38.65 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  38.41 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  34.89 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  37.23 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  35.66 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  31.44 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  30.26 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  38.06 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  30.26 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  38.81 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  35.56 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  38.81 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  38.81 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  30.67 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  38.16 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  38.16 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  38.16 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  38.02 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  33.8 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  38.16 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  38.55 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  38.02 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  35.19 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  38.16 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  38.16 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  36.57 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  37.12 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  34.52 
 
 		 288 aa  155  9e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  32.55 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  34.14 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>