More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0129 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  611  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  68.6 
 
 
293 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  66.9 
 
 
294 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  64.07 
 
 
298 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  63.39 
 
 
298 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  62.03 
 
 
298 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  63.03 
 
 
299 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  62.63 
 
 
290 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  63.23 
 
 
299 aa  384  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  62.63 
 
 
290 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  61.05 
 
 
310 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  60.21 
 
 
307 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  63.31 
 
 
304 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  53.15 
 
 
284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.75 
 
 
284 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  51.77 
 
 
285 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  47.5 
 
 
283 aa  296  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  48.91 
 
 
286 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  49.28 
 
 
285 aa  285  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  48.42 
 
 
285 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  49.12 
 
 
284 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  47.69 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  49.3 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  48.95 
 
 
287 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  47.55 
 
 
283 aa  278  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  48.19 
 
 
285 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  46.93 
 
 
280 aa  275  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  45.39 
 
 
283 aa  275  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  44.04 
 
 
279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  41.7 
 
 
286 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  46.38 
 
 
274 aa  255  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  46.62 
 
 
289 aa  255  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  40.79 
 
 
285 aa  255  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  40.99 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  40.99 
 
 
286 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  41.32 
 
 
296 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  41.73 
 
 
279 aa  242  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  41.67 
 
 
277 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  40.8 
 
 
303 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  37.29 
 
 
302 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  40.2 
 
 
303 aa  235  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  39.93 
 
 
282 aa  235  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  39.73 
 
 
300 aa  234  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  41.9 
 
 
303 aa  232  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  37.46 
 
 
301 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  40 
 
 
312 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  38.93 
 
 
302 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  38.78 
 
 
301 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  39.79 
 
 
303 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  37.54 
 
 
290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  37.71 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  41.07 
 
 
283 aa  225  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  38.85 
 
 
303 aa  225  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  37.71 
 
 
309 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  37.76 
 
 
302 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  41.07 
 
 
286 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  41.87 
 
 
290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.79 
 
 
282 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  43.32 
 
 
279 aa  222  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  40.36 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  41.5 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  39.5 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  37.5 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  39.79 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  40.89 
 
 
290 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  40.89 
 
 
290 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  40.89 
 
 
290 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  36.64 
 
 
306 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  41.92 
 
 
292 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  41.3 
 
 
290 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  40.82 
 
 
290 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  41.75 
 
 
288 aa  216  4e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  40.82 
 
 
290 aa  215  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  38.33 
 
 
301 aa  212  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  40.21 
 
 
299 aa  211  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  41.44 
 
 
290 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  41.44 
 
 
290 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  41.44 
 
 
290 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  40.58 
 
 
283 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  41.1 
 
 
290 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  41.1 
 
 
290 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  41.1 
 
 
290 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  41.16 
 
 
282 aa  208  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  40.21 
 
 
337 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  41.02 
 
 
292 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  40.59 
 
 
282 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  36.77 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22075  putative pirin-related protein  48.1 
 
 
210 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000698368  hitchhiker  1.59239e-20 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  37.62 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  39.85 
 
 
277 aa  192  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  39.18 
 
 
292 aa  191  9e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  37.41 
 
 
278 aa  191  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  37.18 
 
 
288 aa  189  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  40.32 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  37.59 
 
 
286 aa  188  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  34.74 
 
 
282 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  37.29 
 
 
318 aa  185  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  40.15 
 
 
288 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  38.7 
 
 
293 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  36.21 
 
 
288 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>