More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1200 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  100 
 
 
283 aa  587  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  58.21 
 
 
280 aa  345  4e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  51.77 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.41 
 
 
310 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  53.7 
 
 
285 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  48.62 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  48.62 
 
 
298 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  49.3 
 
 
298 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  47.5 
 
 
294 aa  296  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  54.32 
 
 
283 aa  295  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  48.23 
 
 
304 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  49.12 
 
 
290 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  49.12 
 
 
290 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  49.64 
 
 
283 aa  293  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  51.06 
 
 
287 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  48.92 
 
 
293 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  49.82 
 
 
286 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  48.75 
 
 
299 aa  284  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  50.36 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  48.75 
 
 
294 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  49.11 
 
 
299 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  49.82 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  49.82 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  49.11 
 
 
286 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  45.49 
 
 
279 aa  267  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  46.24 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  46.43 
 
 
279 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  46.81 
 
 
284 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  44 
 
 
277 aa  263  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  44.29 
 
 
284 aa  261  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  44.84 
 
 
285 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  46.24 
 
 
285 aa  260  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  46.4 
 
 
296 aa  260  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  45.55 
 
 
284 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  46.24 
 
 
285 aa  258  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  44.24 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  46.13 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  45.16 
 
 
285 aa  248  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  41.28 
 
 
301 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  46.5 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  43.26 
 
 
283 aa  240  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  41.33 
 
 
309 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  41.02 
 
 
302 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  41 
 
 
309 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  40.2 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  42.29 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  40.88 
 
 
303 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  39.73 
 
 
302 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  39.86 
 
 
300 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  41.13 
 
 
282 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  45.26 
 
 
290 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  40.2 
 
 
303 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  41.1 
 
 
306 aa  226  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  39.02 
 
 
290 aa  226  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  42.14 
 
 
278 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40 
 
 
282 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  39.43 
 
 
286 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  42.55 
 
 
288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  40.94 
 
 
302 aa  221  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  44.21 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  40 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  39.13 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  44.56 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  43.86 
 
 
290 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  44.32 
 
 
283 aa  218  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  44.21 
 
 
290 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  43.9 
 
 
299 aa  218  7e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  44.21 
 
 
290 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  44.21 
 
 
290 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  42.23 
 
 
303 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  39.5 
 
 
282 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  43.25 
 
 
298 aa  215  5e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  40.27 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  41.92 
 
 
292 aa  212  7e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  41.84 
 
 
290 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  41.84 
 
 
290 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  41.05 
 
 
303 aa  208  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  41.84 
 
 
290 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  41.84 
 
 
337 aa  208  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  41.84 
 
 
290 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  41.84 
 
 
290 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  41.84 
 
 
290 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  40.83 
 
 
292 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  40.93 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  41.72 
 
 
290 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  41.32 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  41.11 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 
337 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  36.43 
 
 
282 aa  185  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  39.48 
 
 
318 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  37.05 
 
 
279 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22075  putative pirin-related protein  43 
 
 
210 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000698368  hitchhiker  1.59239e-20 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  35.93 
 
 
286 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  36.3 
 
 
277 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  35.64 
 
 
293 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  38.11 
 
 
337 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  37.85 
 
 
301 aa  176  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  37.55 
 
 
288 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  39.93 
 
 
328 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  41.04 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>