More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3449 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  100 
 
 
302 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  75.5 
 
 
309 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  75.17 
 
 
309 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  66.78 
 
 
302 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  64.31 
 
 
300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  61.46 
 
 
302 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  57.48 
 
 
301 aa  362  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  56.57 
 
 
285 aa  352  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  56.44 
 
 
296 aa  345  5e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  56.77 
 
 
312 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  58.33 
 
 
302 aa  342  4e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  55.81 
 
 
290 aa  340  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  53.47 
 
 
301 aa  329  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  52.82 
 
 
283 aa  315  8e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  50.66 
 
 
303 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  50.33 
 
 
303 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  52.38 
 
 
282 aa  299  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  49.84 
 
 
303 aa  298  5e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  51.97 
 
 
303 aa  298  7e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  49.34 
 
 
303 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  46.64 
 
 
289 aa  263  4e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  47.97 
 
 
286 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  47.64 
 
 
286 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  47.14 
 
 
286 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  46.62 
 
 
279 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  45.89 
 
 
306 aa  254  9e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  45.12 
 
 
286 aa  251  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  44.75 
 
 
298 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  46.69 
 
 
288 aa  244  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  42.47 
 
 
280 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  43.14 
 
 
285 aa  242  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  43.05 
 
 
298 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  43.05 
 
 
298 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  42.47 
 
 
286 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  43.59 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  41.08 
 
 
285 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  38.93 
 
 
294 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  39.73 
 
 
283 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.55 
 
 
310 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  40.8 
 
 
285 aa  228  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  41.5 
 
 
299 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  41.14 
 
 
283 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.16 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  40.47 
 
 
287 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  41.36 
 
 
307 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  40.94 
 
 
294 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  41.98 
 
 
283 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  41.16 
 
 
299 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  40 
 
 
284 aa  222  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  40.47 
 
 
278 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  42.95 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  41.29 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  40.8 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  41.72 
 
 
290 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  41.39 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  41.39 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  41.39 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  41.39 
 
 
290 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  41.39 
 
 
290 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  41.69 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  40.47 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  41.69 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  40.73 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  39.74 
 
 
284 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  40.73 
 
 
290 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.46 
 
 
284 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  39.8 
 
 
293 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  37.46 
 
 
274 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  39.74 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  39.74 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  39.74 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  39.74 
 
 
337 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  39.87 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  39.4 
 
 
290 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  39.4 
 
 
290 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  39.4 
 
 
290 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  37.94 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  37.46 
 
 
279 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  37.75 
 
 
285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  37.68 
 
 
279 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  39.4 
 
 
292 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  36.72 
 
 
289 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  36.33 
 
 
318 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  36 
 
 
328 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  39.6 
 
 
310 aa  185  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  36.12 
 
 
301 aa  183  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  37.95 
 
 
337 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  37.29 
 
 
282 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  36.43 
 
 
283 aa  179  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  37.29 
 
 
320 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  30.9 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  35.29 
 
 
346 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  31.88 
 
 
293 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  36.6 
 
 
286 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  30.72 
 
 
285 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  34.31 
 
 
322 aa  168  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  35.57 
 
 
282 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  31.44 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  30.39 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  34.1 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>