More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1390 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  100 
 
 
304 aa  627  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  66.55 
 
 
307 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  65.38 
 
 
310 aa  387  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  65.61 
 
 
298 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  65.61 
 
 
298 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  64.91 
 
 
298 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  63.89 
 
 
293 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  65.48 
 
 
299 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  64.62 
 
 
294 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  63.31 
 
 
294 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  59.86 
 
 
290 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  59.86 
 
 
290 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  64.31 
 
 
299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  54.23 
 
 
284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  52.46 
 
 
284 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  48.23 
 
 
283 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  51.96 
 
 
285 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  49.28 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  49.82 
 
 
286 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  51.09 
 
 
274 aa  276  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  47.04 
 
 
285 aa  275  8e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  49.82 
 
 
284 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  47.86 
 
 
284 aa  272  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  49.82 
 
 
289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  48.95 
 
 
284 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  50.54 
 
 
283 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  47.69 
 
 
286 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  47.29 
 
 
285 aa  265  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  47.1 
 
 
280 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  47.33 
 
 
286 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  46.98 
 
 
286 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  45.99 
 
 
279 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  45.65 
 
 
285 aa  258  8e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  44.73 
 
 
283 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  44.96 
 
 
282 aa  242  7e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  41.36 
 
 
301 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  43.77 
 
 
300 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  41.26 
 
 
290 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  43.73 
 
 
296 aa  238  9e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  42.37 
 
 
303 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  39.32 
 
 
301 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  42.81 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  41.82 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  41.02 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  42.03 
 
 
303 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  44.01 
 
 
303 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  43.01 
 
 
283 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  41.16 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  39.86 
 
 
279 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  40.54 
 
 
303 aa  225  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  40.29 
 
 
289 aa  223  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  42.18 
 
 
286 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  40.57 
 
 
282 aa  221  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  39.42 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  41.58 
 
 
337 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  39.12 
 
 
302 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.14 
 
 
282 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  42.96 
 
 
290 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  42.96 
 
 
290 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  42.96 
 
 
290 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  42.96 
 
 
290 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  42.96 
 
 
290 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  41.07 
 
 
282 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  42.96 
 
 
290 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  40.85 
 
 
303 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  42.81 
 
 
290 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  42.81 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  38.93 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  42.81 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  41.9 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  42.44 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  42.81 
 
 
290 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  43.16 
 
 
290 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  41.9 
 
 
290 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  38.26 
 
 
309 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  40.83 
 
 
292 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  40.64 
 
 
288 aa  209  5e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  37.33 
 
 
306 aa  208  7e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  39.65 
 
 
299 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  38.54 
 
 
298 aa  206  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  38.78 
 
 
302 aa  206  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  40.74 
 
 
282 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  41.52 
 
 
279 aa  202  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  39.05 
 
 
278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22075  putative pirin-related protein  48.56 
 
 
210 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000698368  hitchhiker  1.59239e-20 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  39.44 
 
 
290 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  38.73 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.7122 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  38.7 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  39.1 
 
 
292 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  37.05 
 
 
337 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  38.91 
 
 
282 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  37.5 
 
 
301 aa  189  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  37.36 
 
 
288 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  37.05 
 
 
282 aa  182  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  41.15 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  36.96 
 
 
286 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  39.38 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  39 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  37.68 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  39.37 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>