More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0487 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  57.54 
 
 
284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  54.51 
 
 
284 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  51.23 
 
 
299 aa  291  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  52.98 
 
 
285 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  53.55 
 
 
286 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  51.24 
 
 
290 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  51.24 
 
 
290 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  52.82 
 
 
284 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  50.53 
 
 
284 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  47.69 
 
 
294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  51.43 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  49.12 
 
 
285 aa  280  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  48.06 
 
 
310 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  49.11 
 
 
293 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  49.11 
 
 
285 aa  279  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  49.83 
 
 
298 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  49.31 
 
 
298 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  49.29 
 
 
294 aa  275  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  49.13 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  46.59 
 
 
280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  50.89 
 
 
289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  48.24 
 
 
307 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  47.86 
 
 
304 aa  272  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  47.54 
 
 
299 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  50.71 
 
 
283 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  44.29 
 
 
283 aa  261  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  46.62 
 
 
287 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  48.93 
 
 
274 aa  259  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  45.49 
 
 
279 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  46.95 
 
 
283 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  45.13 
 
 
277 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  43.93 
 
 
279 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  44.95 
 
 
286 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  44.95 
 
 
286 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  43.75 
 
 
290 aa  249  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  44.95 
 
 
286 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  45.07 
 
 
289 aa  248  9e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  44.8 
 
 
282 aa  245  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  43.82 
 
 
296 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  43.62 
 
 
283 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  43.46 
 
 
285 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  42.52 
 
 
303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  42.33 
 
 
300 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  44.98 
 
 
282 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  39 
 
 
301 aa  235  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  43.42 
 
 
282 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  42.56 
 
 
303 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  40.67 
 
 
301 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  42.5 
 
 
286 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  40.73 
 
 
312 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  38.21 
 
 
303 aa  224  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 
282 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  38.46 
 
 
302 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  37.87 
 
 
303 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  40 
 
 
302 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  38 
 
 
302 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  38.67 
 
 
309 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  42.86 
 
 
285 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  39.59 
 
 
306 aa  216  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  42.81 
 
 
290 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  42.38 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  41.91 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  38.75 
 
 
303 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  42.49 
 
 
285 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 
285 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  42.7 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  38.8 
 
 
302 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  37.67 
 
 
309 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  40.52 
 
 
283 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  40.28 
 
 
295 aa  209  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  41.9 
 
 
278 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  42.07 
 
 
285 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  39.79 
 
 
282 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.33 
 
 
285 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  41.7 
 
 
285 aa  205  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  40.58 
 
 
293 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  42.07 
 
 
285 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  39.58 
 
 
288 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  38.38 
 
 
279 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 
288 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  41.94 
 
 
284 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22075  putative pirin-related protein  50 
 
 
210 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000698368  hitchhiker  1.59239e-20 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  40.07 
 
 
292 aa  198  7.999999999999999e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  38.14 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  40.62 
 
 
290 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  40.62 
 
 
290 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  40.62 
 
 
290 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  40.62 
 
 
290 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  40.62 
 
 
290 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  40.62 
 
 
290 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  38.19 
 
 
290 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  37.63 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  36.24 
 
 
298 aa  188  9e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  37.41 
 
 
277 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  38.06 
 
 
290 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  37.85 
 
 
290 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  38.19 
 
 
290 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  38.89 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  38.19 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>