More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3859 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  88.03 
 
 		 284 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  72.54 
 
 		 284 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  71.07 
 
 		 285 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  55.87 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  56.03 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  56.03 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  53.15 
 
 		 294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  54.23 
 
 		 304 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22075  putative pirin-related protein  69.86 
 
 		 210 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000698368  hitchhiker  1.59239e-20 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  54.04 
 
 		 289 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  57.93 
 
 		 284 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  54.77 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  55.05 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  53.45 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  53.98 
 
 		 298 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  53.26 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  52.82 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  52.3 
 
 		 310 aa  285  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  55 
 
 		 283 aa  285  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  54.33 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  50.35 
 
 		 280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  50.7 
 
 		 285 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  51.06 
 
 		 307 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  50.36 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  46.81 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  47.18 
 
 		 287 aa  262  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  48.23 
 
 		 285 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  47.87 
 
 		 285 aa  255  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  47.65 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  44.37 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  43.17 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  46.21 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  45 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  45.8 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  45.45 
 
 		 286 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  46.3 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  45.62 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  46.18 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.81 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  45.42 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  43.97 
 
 		 279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  42.6 
 
 		 285 aa  228  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  41.13 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  40 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  41.94 
 
 		 282 aa  221  9e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  43.36 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  42.71 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  38.46 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 		 298 aa  214  9e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  39.8 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  40.94 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  40.47 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  38.54 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  42.14 
 
 		 288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  44.13 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  41.08 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  41.32 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  39.47 
 
 		 309 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  38.8 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  39.8 
 
 		 303 aa  208  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  39.26 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  38.11 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  39.5 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  39.14 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  38.38 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  40.93 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  40.93 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  40.93 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  38.59 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 		 285 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  40.14 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  39.79 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  40.07 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  42.32 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  40.33 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  39.01 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  41.58 
 
 		 278 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  39.73 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  40.99 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  38.13 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  39.58 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  42.32 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  39.22 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  40.61 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  40.61 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  40.61 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  40.61 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  40.61 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  40.61 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  36.46 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  41.64 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  41.64 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  39.63 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  37.02 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  40.96 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  40.96 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  40.96 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>