More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0798 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  85.76 
 
 		 310 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  68.64 
 
 		 293 aa  417  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  68.28 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  68.28 
 
 		 298 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  67.93 
 
 		 294 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  67.59 
 
 		 298 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  66.55 
 
 		 304 aa  391  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  67.48 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  64.91 
 
 		 290 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  64.91 
 
 		 290 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  62.98 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  60.21 
 
 		 294 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  51.77 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  51.92 
 
 		 285 aa  301  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  46.34 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  50.17 
 
 		 283 aa  285  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  52.71 
 
 		 283 aa  282  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  51.05 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  51.59 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  51.06 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  50.71 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  50.7 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.06 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  50.35 
 
 		 286 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  49.65 
 
 		 285 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  47.18 
 
 		 280 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  48.24 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  49.47 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  49.29 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  48.57 
 
 		 285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  50 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  48.23 
 
 		 279 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  47.2 
 
 		 289 aa  256  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  41.28 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  40.78 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  43.9 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  43.42 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  40.5 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  38.21 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  42.29 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  41.43 
 
 		 289 aa  228  9e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  46.23 
 
 		 290 aa  225  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  42.18 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  40.74 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  41.55 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  42.7 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  41.81 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  41.36 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  46.23 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  42.37 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  46.58 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  39.8 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  46.23 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  37.98 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  46.23 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  46.23 
 
 		 290 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  46.05 
 
 		 290 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.11 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  46.05 
 
 		 290 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  46.05 
 
 		 290 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  45.89 
 
 		 290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  45.7 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  45.7 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  45.7 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  45.39 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  38.38 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  40.34 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  39.32 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  39.4 
 
 		 309 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  38.74 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  45.21 
 
 		 337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  40.93 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  41.96 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  43.51 
 
 		 303 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  39.6 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  41.32 
 
 		 288 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  39.13 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  42.61 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  40.75 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  41.9 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  40.85 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  43.49 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  41.72 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  39.72 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  40 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  38.97 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  37.86 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  39.01 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  39.46 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  38.63 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  39.86 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  41.09 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22075  putative pirin-related protein  45.07 
 
 		 210 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000698368  hitchhiker  1.59239e-20 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  41.47 
 
 		 282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  36.11 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  37.85 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  35.58 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  41.88 
 
 		 290 aa  178  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.528503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>