More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1404 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  100 
 
 
292 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  94.52 
 
 
292 aa  544  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  84.93 
 
 
290 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  76.9 
 
 
290 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  78.28 
 
 
290 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  76.21 
 
 
290 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  77.59 
 
 
290 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  75.86 
 
 
290 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  75.86 
 
 
290 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  75.95 
 
 
290 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  71.82 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  71.82 
 
 
290 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  71.82 
 
 
290 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  71.82 
 
 
290 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  71.82 
 
 
290 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  71.82 
 
 
290 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  71.82 
 
 
290 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  51.01 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  51.03 
 
 
320 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  47.02 
 
 
328 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  49.3 
 
 
318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  46.05 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  46.94 
 
 
322 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  46.92 
 
 
322 aa  248  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  45.61 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  44.9 
 
 
324 aa  242  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  45.24 
 
 
315 aa  239  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  46.26 
 
 
298 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  44.22 
 
 
324 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  43.33 
 
 
328 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  43.33 
 
 
328 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  43.33 
 
 
328 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  45.92 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  42.71 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  45.24 
 
 
298 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  43.58 
 
 
342 aa  228  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  43.49 
 
 
286 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  46.23 
 
 
285 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  43.58 
 
 
299 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  43.1 
 
 
310 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  44.67 
 
 
299 aa  221  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  45.83 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  45.49 
 
 
283 aa  217  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  40.41 
 
 
310 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  41.92 
 
 
294 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  44.6 
 
 
288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  44.24 
 
 
301 aa  215  8e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  43.05 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  43.3 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  43.3 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  40.83 
 
 
304 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  43.8 
 
 
288 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  42.86 
 
 
285 aa  208  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  44.28 
 
 
293 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  42.61 
 
 
307 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  41.87 
 
 
282 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  40.51 
 
 
287 aa  206  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  42.56 
 
 
296 aa  205  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  39.74 
 
 
302 aa  205  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  40.46 
 
 
300 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28358  RNA pol II transcription cofactor  38.78 
 
 
339 aa  204  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  44.29 
 
 
274 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  39.87 
 
 
302 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  45.62 
 
 
288 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  43.4 
 
 
286 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  41.52 
 
 
282 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  40.83 
 
 
283 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  43.75 
 
 
286 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  42.12 
 
 
293 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  43.75 
 
 
286 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  40.2 
 
 
337 aa  202  7e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  40.97 
 
 
286 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  43.01 
 
 
288 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  42.71 
 
 
283 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  43.01 
 
 
288 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  43.54 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  42.8 
 
 
286 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  43.01 
 
 
288 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  41.3 
 
 
293 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  42.8 
 
 
286 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  43.87 
 
 
287 aa  199  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  42.8 
 
 
286 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  42.8 
 
 
286 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  42.8 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  41.91 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  39.8 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  37.7 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  41.11 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  42.81 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  42.51 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  42.14 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  43.26 
 
 
290 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  40.06 
 
 
303 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  39.79 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  41.88 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  41.58 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  41.3 
 
 
284 aa  195  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.7 
 
 
293 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  41.54 
 
 
288 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  41.54 
 
 
288 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>