More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3743 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3743  pirin  100 
 
 		 289 aa  597  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  53.68 
 
 		 284 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  54.04 
 
 		 284 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  54.2 
 
 		 285 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  52.94 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  53.31 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  50.89 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  49.31 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  49.82 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  50.35 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  49.82 
 
 		 304 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  48.43 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  46.08 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  47.55 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  48.08 
 
 		 290 aa  258  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  48.08 
 
 		 290 aa  258  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  46.76 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  47.2 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  46.42 
 
 		 298 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  46.62 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  46.76 
 
 		 298 aa  255  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  45.14 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  46.29 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  48.77 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  44.91 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  47.62 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  44.17 
 
 		 280 aa  244  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  46.5 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  46.53 
 
 		 286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  42.11 
 
 		 282 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  41.75 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  42.36 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 		 282 aa  225  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  40.93 
 
 		 277 aa  221  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  42.31 
 
 		 289 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  39.58 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  40.49 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  43.01 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  41.81 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  39.37 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  40.75 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  40.41 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  40.41 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  41.67 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  41.67 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  40.91 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  41.13 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  40.78 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  39 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  37.17 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  40.43 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  38.36 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  38.03 
 
 		 309 aa  205  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  38.76 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  39.66 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  42.24 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  41.45 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  37.5 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  40.07 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22075  putative pirin-related protein  50.7 
 
 		 210 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000698368  hitchhiker  1.59239e-20 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  37.81 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  41.61 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  41.2 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  41.2 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  37.38 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  40 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  36.81 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  40.55 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  39.14 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  37.98 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  39.04 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  40.78 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  41.55 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  39.57 
 
 		 290 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  37.63 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  39.06 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  37.05 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  36.72 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  36.6 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  35.95 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  41.55 
 
 		 290 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  37.1 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  38.97 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  37.79 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  38.38 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  35.71 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  40.57 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  36.62 
 
 		 279 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  41.2 
 
 		 290 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  38.64 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  38.64 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  38.64 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  38.64 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  38.64 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  35.83 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  38.64 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  41.49 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  41.49 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>