More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1112 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  577  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  85.92 
 
 		 285 aa  497  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  68.31 
 
 		 286 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  52.52 
 
 		 285 aa  291  8e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  50.71 
 
 		 284 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  49.28 
 
 		 294 aa  285  4e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  55.04 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  49.12 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  50.68 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  49.29 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  50.36 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  48.75 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  49.47 
 
 		 307 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  48.75 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  48.75 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  48.08 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  48.01 
 
 		 280 aa  265  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  47.29 
 
 		 304 aa  265  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  47.04 
 
 		 298 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  47.72 
 
 		 298 aa  262  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  46.24 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  44.93 
 
 		 285 aa  258  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  45.32 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  46.95 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  45.23 
 
 		 296 aa  256  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  45.52 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  48.19 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  46.81 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  47.87 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  45.88 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  46.69 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  46.67 
 
 		 286 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  41.86 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  46.67 
 
 		 286 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  46.67 
 
 		 286 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  46.43 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  44.91 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  46.4 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  43.14 
 
 		 302 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  44.21 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  44.22 
 
 		 303 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  44.13 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  43.33 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  42 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  41.79 
 
 		 278 aa  234  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  42.09 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  41.53 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  43.01 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  39.93 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  41.33 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  41.75 
 
 		 309 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  41.33 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  45.88 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 		 282 aa  228  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  42.11 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  39.93 
 
 		 277 aa  228  9e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  40.07 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  40.36 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  39.6 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  42.25 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  42.14 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  43.32 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  44.14 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  37.71 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  38.49 
 
 		 279 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  44.14 
 
 		 290 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  43.79 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  42.76 
 
 		 290 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  42.96 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  42.41 
 
 		 290 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  42.86 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  43.57 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  42.41 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  42.41 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  42.76 
 
 		 337 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  40.28 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  43.4 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  43.4 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  43.4 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  36.82 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  43.06 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  43.06 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  43.06 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  42.11 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  38.18 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  42.86 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  40.5 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  39.19 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  39.37 
 
 		 283 aa  192  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  38.99 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  39.1 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  40.14 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  38.01 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  38.95 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  38.15 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  38.15 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  38.18 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28358  RNA pol II transcription cofactor  38.03 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  37.78 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>