More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2003 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  58.21 
 
 		 283 aa  345  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  53.71 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  51.22 
 
 		 298 aa  292  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  48.93 
 
 		 283 aa  292  5e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  52.9 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.06 
 
 		 284 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  48.06 
 
 		 285 aa  284  9e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  50.35 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  49.12 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  49.47 
 
 		 294 aa  281  8.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  48.28 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  48.28 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  48.92 
 
 		 286 aa  279  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  47.18 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  48.23 
 
 		 290 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  48.23 
 
 		 290 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  46.93 
 
 		 294 aa  275  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  47.18 
 
 		 307 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  48.97 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  46.59 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  48.74 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  45.09 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  45.49 
 
 		 279 aa  268  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  48.23 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  48.01 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  47.1 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  47.33 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  46.93 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  46.21 
 
 		 284 aa  258  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  49.62 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  45.36 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  45.32 
 
 		 279 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  46.93 
 
 		 286 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  46.21 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  46.21 
 
 		 286 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 		 296 aa  247  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  44.17 
 
 		 289 aa  244  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  42.47 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  43.32 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  45.36 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  42.55 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  41.14 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  42.09 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  42.76 
 
 		 309 aa  232  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  39.33 
 
 		 301 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  42.39 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  42.47 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  41.22 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  41.1 
 
 		 306 aa  225  5.0000000000000005e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  44.84 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  38.26 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  38.78 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  40.54 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  42.28 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  40.07 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  39.26 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  40.13 
 
 		 312 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  38.05 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  39.93 
 
 		 282 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  38.93 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  39.08 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  39.6 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.52 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  42.11 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  42.27 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  37.91 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  40.42 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  38.93 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  40 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  37.72 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  38.41 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  38.55 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  38.23 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  39.58 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  37.11 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  39.58 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  36.88 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  39.93 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  38.95 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  38.95 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  38.95 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  35.92 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  36.71 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  37.09 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  35.92 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  36.73 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  35.56 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  36.73 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  34.95 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  36.08 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  37.07 
 
 		 323 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  36.3 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  35.14 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  37.23 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  37.23 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  35.17 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  37.23 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  36.97 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>