More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0624 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  100 
 
 
323 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  79.69 
 
 
324 aa  531  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  76 
 
 
328 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  76 
 
 
328 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  76 
 
 
328 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  73.75 
 
 
324 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  70.31 
 
 
322 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  68.75 
 
 
322 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  64.33 
 
 
315 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  62.73 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  64.09 
 
 
346 aa  408  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  62.42 
 
 
342 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  58.33 
 
 
328 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  58.26 
 
 
337 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  54.46 
 
 
320 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  51.38 
 
 
318 aa  298  1e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  43.49 
 
 
290 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  42.81 
 
 
290 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  43.15 
 
 
290 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  42.71 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  42.47 
 
 
290 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  41.78 
 
 
290 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  42.47 
 
 
290 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  42.47 
 
 
290 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  42.12 
 
 
290 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  40.14 
 
 
337 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  39.66 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  39.66 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  39.66 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  42.37 
 
 
292 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  44.22 
 
 
288 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  44.22 
 
 
288 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  44.22 
 
 
288 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  39.66 
 
 
290 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  39.66 
 
 
290 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  39.66 
 
 
290 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  43.54 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  43.54 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  43.58 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  43.2 
 
 
288 aa  212  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  44.29 
 
 
288 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  40.48 
 
 
286 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  43.05 
 
 
288 aa  205  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  42.71 
 
 
288 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  40.07 
 
 
286 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  42.57 
 
 
293 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  40.07 
 
 
286 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  42.36 
 
 
288 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  39.73 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  39.73 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  43.58 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  40.75 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  42.91 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  41.64 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  39.38 
 
 
286 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  41.07 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  41.26 
 
 
288 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  41.26 
 
 
288 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  41.26 
 
 
288 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  41.26 
 
 
288 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  41.26 
 
 
288 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  41.26 
 
 
288 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  40.91 
 
 
288 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  39.73 
 
 
293 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  39.6 
 
 
289 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  39.6 
 
 
289 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  39.6 
 
 
289 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  40.48 
 
 
293 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  39.18 
 
 
298 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  40 
 
 
290 aa  188  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  38.24 
 
 
298 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  39.29 
 
 
286 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  37.93 
 
 
298 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  39.36 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  40.78 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  40.21 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  38.24 
 
 
311 aa  182  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  40.07 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  36.92 
 
 
290 aa  182  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  37.62 
 
 
294 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  37.07 
 
 
293 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  39.58 
 
 
288 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  38.35 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  39.18 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  37.94 
 
 
295 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  35.58 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  37.63 
 
 
286 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  36.13 
 
 
303 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  36.4 
 
 
293 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  38.44 
 
 
299 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  39.78 
 
 
303 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  39.18 
 
 
291 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  41.63 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  36.98 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  37.71 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  36.93 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  35.74 
 
 
277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  36.15 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  37.07 
 
 
280 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  37.29 
 
 
299 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>