More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0792 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  100 
 
 
293 aa  597  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0776  pirin-like protein  97.42 
 
 
155 aa  299  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  50.18 
 
 
290 aa  295  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  49.83 
 
 
288 aa  292  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  48.25 
 
 
288 aa  288  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  49.13 
 
 
293 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  48.25 
 
 
292 aa  286  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1938  pirin family protein  53.15 
 
 
288 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0765198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  46.85 
 
 
289 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  46.85 
 
 
289 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  46.85 
 
 
289 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  46.34 
 
 
288 aa  280  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  48.1 
 
 
288 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  45.8 
 
 
286 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  43.9 
 
 
290 aa  277  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  45.8 
 
 
286 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  45.8 
 
 
286 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  46.85 
 
 
288 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  45.8 
 
 
286 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  47.04 
 
 
293 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  46.92 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  45.45 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  44.25 
 
 
293 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  45.3 
 
 
288 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  47.7 
 
 
288 aa  272  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  44.95 
 
 
288 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  44.95 
 
 
288 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  44.95 
 
 
288 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  44.95 
 
 
288 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  44.95 
 
 
288 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  44.95 
 
 
288 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  44.64 
 
 
295 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  44.06 
 
 
295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  47.06 
 
 
288 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  47.06 
 
 
288 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  47.06 
 
 
288 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  47.06 
 
 
288 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  44.6 
 
 
288 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  44.41 
 
 
288 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  47.06 
 
 
288 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  45.8 
 
 
290 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  44.29 
 
 
295 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  43.94 
 
 
291 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 
305 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  46.39 
 
 
290 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  44.95 
 
 
287 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  43.36 
 
 
293 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  45.45 
 
 
303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  45.26 
 
 
286 aa  258  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  43.36 
 
 
287 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  45.14 
 
 
286 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  44.37 
 
 
286 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  44.56 
 
 
286 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  41.5 
 
 
311 aa  226  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  35.29 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  35.52 
 
 
290 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  38.18 
 
 
346 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  39.02 
 
 
328 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  39.31 
 
 
287 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  35.55 
 
 
337 aa  191  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  38.13 
 
 
331 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  37.88 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  35.17 
 
 
290 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  35.17 
 
 
290 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  35.17 
 
 
290 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  35.17 
 
 
290 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  36.36 
 
 
282 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  35.37 
 
 
315 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  35.27 
 
 
324 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  35.17 
 
 
290 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  35.17 
 
 
290 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  38.01 
 
 
290 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  35.74 
 
 
324 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  34.93 
 
 
290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  34.93 
 
 
290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  34.93 
 
 
290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  34.93 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  34.93 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  34.83 
 
 
337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  34.93 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  34.58 
 
 
342 aa  182  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  37.07 
 
 
323 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  35.97 
 
 
282 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  35.47 
 
 
328 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  35.47 
 
 
328 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  35.47 
 
 
328 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  37.54 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  37.05 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  35.74 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  36.08 
 
 
322 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  35.84 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  35.64 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  34.36 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  34.07 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  35.19 
 
 
287 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  35.71 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  38.6 
 
 
283 aa  161  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  40 
 
 
277 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  37.33 
 
 
290 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  32.3 
 
 
294 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>