More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2562 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  100 
 
 		 288 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  71.53 
 
 		 288 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  72.38 
 
 		 293 aa  428  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  70.49 
 
 		 288 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  70.83 
 
 		 288 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  69.79 
 
 		 288 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  69.1 
 
 		 288 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  69.1 
 
 		 288 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  69.1 
 
 		 288 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  68.75 
 
 		 288 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  68.06 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  68.06 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  63.54 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  68.06 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  68.62 
 
 		 290 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  68.06 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  68.06 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  68.06 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  68.06 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  66.44 
 
 		 293 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  63.99 
 
 		 288 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  65.38 
 
 		 292 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  64.58 
 
 		 305 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  64.34 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  62.15 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  62.94 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  63.64 
 
 		 288 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  62.24 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  61.89 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  61.89 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  63.19 
 
 		 290 aa  378  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  61.54 
 
 		 286 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  61.54 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  59.79 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  60.84 
 
 		 293 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  59.79 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  59.79 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  62.15 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  61.75 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  60.49 
 
 		 290 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  61.05 
 
 		 286 aa  359  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  59.79 
 
 		 291 aa  347  9e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  58.74 
 
 		 295 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  58.04 
 
 		 295 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  58.39 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  59.09 
 
 		 287 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  57.24 
 
 		 286 aa  334  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  51.05 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  48.42 
 
 		 290 aa  298  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  48.25 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  44.74 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1938  pirin family protein  46.71 
 
 		 288 aa  259  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  48.54 
 
 		 286 aa  256  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  40.71 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  42.86 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  41.33 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  40.87 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  41.5 
 
 		 286 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  42.14 
 
 		 322 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  40.96 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  41.18 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  40.2 
 
 		 337 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  40.5 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  39.25 
 
 		 331 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  39.48 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  44.48 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  41.07 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  40.22 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  40.81 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  39.85 
 
 		 290 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  40.22 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  40.22 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  40.22 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  40.22 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  40.22 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  40.22 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  39.85 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  39.85 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5014  Pirin domain protein  38.1 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  37.54 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  40.07 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  38.98 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  39.85 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  35 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  39.03 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  41.11 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  41.11 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  41.11 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 		 324 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  36.51 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  39.5 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  39.71 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  37.21 
 
 		 287 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  40.49 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  38.17 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  39.12 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  38.13 
 
 		 283 aa  162  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  40.32 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  37.85 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  34.93 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>