More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0017 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  100 
 
 		 299 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  68.06 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  69.18 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  68.15 
 
 		 298 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  68.31 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  64.38 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  64.11 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  64.11 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  63.03 
 
 		 294 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  64.01 
 
 		 294 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  62.98 
 
 		 307 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  65.48 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  62.98 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  55.05 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  54.01 
 
 		 284 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  48.75 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  51.99 
 
 		 285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  46.85 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  51.22 
 
 		 284 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  51.06 
 
 		 285 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  51.38 
 
 		 284 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  48.74 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  47.54 
 
 		 284 aa  272  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  51.76 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  49.82 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  48.43 
 
 		 289 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  46.18 
 
 		 286 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  45.83 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  47.31 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  45.14 
 
 		 286 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  45.88 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  45.99 
 
 		 283 aa  254  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  46.24 
 
 		 285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  44.84 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  41.37 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  40.65 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  40.88 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  44.1 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  42.05 
 
 		 289 aa  225  8e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  42.5 
 
 		 285 aa  225  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  43.58 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  41.16 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  42.25 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  38.74 
 
 		 302 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  41.99 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  41.58 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  43.73 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  43.69 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  40.34 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  43.2 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  41.14 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  43.2 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  43.39 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  40.27 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  43.2 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  39.8 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  39.8 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  43.05 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  41.07 
 
 		 282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  40.74 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  43.99 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  42.57 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  43.99 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  43.99 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  39.65 
 
 		 282 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  43.99 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  43.99 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  43.99 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  41.95 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  39.73 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  38.68 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  42.36 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  40.8 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  39.32 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  41.05 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  38.33 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  40.83 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  40.42 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  40.07 
 
 		 303 aa  201  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  38.57 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  41.36 
 
 		 302 aa  199  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  40.13 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  37.2 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  39.64 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  38.54 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  38.78 
 
 		 292 aa  192  8e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  40.77 
 
 		 282 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  40.57 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22075  putative pirin-related protein  48.36 
 
 		 210 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000698368  hitchhiker  1.59239e-20 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  39.39 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  36.9 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  38.68 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  37.63 
 
 		 278 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  40.28 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  37.82 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  38.18 
 
 		 331 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  38.36 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  38.91 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  41.47 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>