More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1007 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  100 
 
 
286 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  56.23 
 
 
289 aa  337  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  51.96 
 
 
278 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  46.95 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  49.28 
 
 
283 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  47.31 
 
 
296 aa  259  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  46.57 
 
 
279 aa  258  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  46.18 
 
 
302 aa  255  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  44.63 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  45.12 
 
 
302 aa  251  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  44.95 
 
 
290 aa  250  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  45.64 
 
 
288 aa  250  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  42.67 
 
 
300 aa  248  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  42.81 
 
 
282 aa  245  6e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  45 
 
 
285 aa  245  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  42.71 
 
 
309 aa  244  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  43.37 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  42.37 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  43.33 
 
 
301 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  41.67 
 
 
302 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  41.94 
 
 
286 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  44.13 
 
 
285 aa  238  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  42.21 
 
 
303 aa  238  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  44.33 
 
 
303 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  44.56 
 
 
286 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  44.33 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  43 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  43 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  44.21 
 
 
286 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  44.21 
 
 
286 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  42.72 
 
 
303 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  42.39 
 
 
280 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  43.93 
 
 
279 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  42.58 
 
 
312 aa  228  9e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  42.5 
 
 
284 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  44.77 
 
 
293 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  44.29 
 
 
284 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  42.62 
 
 
302 aa  225  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  40 
 
 
306 aa  225  7e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  40.57 
 
 
287 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  42.86 
 
 
298 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  42.18 
 
 
304 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  39.43 
 
 
283 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  41.07 
 
 
294 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  43.64 
 
 
298 aa  222  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  44.17 
 
 
285 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  42.35 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  42.39 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  41.99 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  42.86 
 
 
298 aa  218  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  43.84 
 
 
299 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  41.07 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  39.37 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  42.2 
 
 
310 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  40.94 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  41.58 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  41.58 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  41.46 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  42.91 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  40.93 
 
 
307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  41.09 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  42.6 
 
 
294 aa  212  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 
283 aa  201  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  39.64 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  37.63 
 
 
277 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  38.43 
 
 
279 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  37.28 
 
 
290 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  36.33 
 
 
301 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  36.24 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  38.13 
 
 
286 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  35.89 
 
 
290 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  35.69 
 
 
310 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  36.84 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  36.84 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  36.84 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  36.84 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  36.71 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  39.49 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  36.84 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  36.84 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  37.73 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  34.17 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  35.89 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  35.36 
 
 
290 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  35.27 
 
 
285 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  35.54 
 
 
290 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  36.4 
 
 
290 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  34.91 
 
 
285 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  34.91 
 
 
285 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  35.19 
 
 
290 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  35.19 
 
 
290 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  34.83 
 
 
315 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  36.93 
 
 
292 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  35.11 
 
 
293 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  35.89 
 
 
320 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  35.4 
 
 
288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  37.28 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  34.74 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  36.54 
 
 
328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  34.63 
 
 
337 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>