More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2950 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  100 
 
 		 288 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  64.58 
 
 		 288 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  63.36 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  63.1 
 
 		 285 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  62.16 
 
 		 295 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  62.76 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  62.76 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  61.86 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  62.15 
 
 		 285 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  62.02 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  62.15 
 
 		 285 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  61.46 
 
 		 285 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.81 
 
 		 285 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  59.23 
 
 		 284 aa  346  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  57.99 
 
 		 277 aa  322  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  46.74 
 
 		 282 aa  258  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  44.44 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  44.33 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  45.29 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  45.68 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.28 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  43.8 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  41.91 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  41.97 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  41.67 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  34.33 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  38.78 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  42.39 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  39.49 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  38.03 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  38.71 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  38.44 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  35.62 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  39.19 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  34.39 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  38.06 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  39.29 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  35.76 
 
 		 300 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  38.13 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.07 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  37.68 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  37.77 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  38.63 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  34.55 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  36.3 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  35.22 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  38.1 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  36.46 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.28 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  34.8 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  37.18 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  35.02 
 
 		 283 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  34.77 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  37.68 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  37.81 
 
 		 298 aa  188  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  38.41 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  36.03 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  35.1 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  32.56 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.36 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  36.62 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  33.22 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  35.77 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  33.9 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  37.41 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  39.13 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  39.13 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  37.05 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  36.5 
 
 		 279 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  31.77 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  31.89 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  31.79 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  37.55 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  36.82 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  34.17 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  30.9 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  35.56 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  33.69 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  32.89 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  33.22 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  34.35 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  34.35 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  34.35 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  34.35 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  34.35 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  34.35 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  36.65 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  31.44 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  34.59 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  32.42 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  34.57 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  33.45 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  34.56 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  34.91 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  35.07 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  33.71 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  33.22 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  35.16 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  34.95 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>