More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000589 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  100 
 
 
282 aa  588  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  76.6 
 
 
282 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  66.67 
 
 
282 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  46.74 
 
 
288 aa  258  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  46.43 
 
 
274 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  46.04 
 
 
284 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  46.38 
 
 
286 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  43.88 
 
 
284 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  43.17 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  43.53 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  43.75 
 
 
293 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  44.01 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  45.05 
 
 
277 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.36 
 
 
285 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  43.64 
 
 
285 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  43.64 
 
 
285 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  43.98 
 
 
282 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  43.22 
 
 
285 aa  235  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  40.99 
 
 
285 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  43.59 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  44.85 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  43.59 
 
 
285 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  43.59 
 
 
285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  42.81 
 
 
290 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  42.4 
 
 
295 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  44.91 
 
 
288 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  41.75 
 
 
289 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  43.42 
 
 
284 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  43.64 
 
 
286 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  40.99 
 
 
287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  40.28 
 
 
284 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  42.76 
 
 
299 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  40.57 
 
 
304 aa  221  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  40.48 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  40.36 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  40.86 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  38.79 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  40.86 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  42.55 
 
 
285 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  40.43 
 
 
294 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  43.32 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  38.38 
 
 
307 aa  218  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  40.48 
 
 
298 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  39.5 
 
 
283 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  40.43 
 
 
293 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  38.06 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.54 
 
 
310 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  39.08 
 
 
280 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  38.68 
 
 
299 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  36.59 
 
 
290 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  37.32 
 
 
285 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  35.97 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  39.43 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  35.87 
 
 
277 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  36.2 
 
 
279 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  35.66 
 
 
286 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  35.66 
 
 
286 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  35.31 
 
 
286 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  34.75 
 
 
301 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  34.17 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  34.51 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  34.51 
 
 
289 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  36.04 
 
 
299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  34.22 
 
 
303 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  34.55 
 
 
303 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  34.55 
 
 
303 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  32.45 
 
 
302 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  35.22 
 
 
302 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  31.33 
 
 
301 aa  175  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  34.78 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  34.04 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  36.14 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  34.88 
 
 
303 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  33.09 
 
 
278 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  35.62 
 
 
331 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  35.02 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  32.12 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  33.67 
 
 
309 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  33.33 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  32.17 
 
 
298 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  35.07 
 
 
286 aa  165  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  32.44 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  31.46 
 
 
302 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  33.81 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  34.84 
 
 
318 aa  163  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  32.56 
 
 
303 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22075  putative pirin-related protein  39.9 
 
 
210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000698368  hitchhiker  1.59239e-20 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  33.78 
 
 
328 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  33.78 
 
 
328 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  33.78 
 
 
328 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  32.62 
 
 
286 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  32.65 
 
 
346 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  32.19 
 
 
306 aa  158  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  34.26 
 
 
322 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  34.14 
 
 
322 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  36.1 
 
 
286 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  33.57 
 
 
282 aa  155  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  35.33 
 
 
323 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  33.78 
 
 
324 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  32.99 
 
 
292 aa  152  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>