More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0805 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  100 
 
 		 293 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  74.74 
 
 		 294 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  73.17 
 
 		 290 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  73.17 
 
 		 290 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  68.6 
 
 		 294 aa  431  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  68.64 
 
 		 307 aa  417  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  66.44 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  66.9 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  66.9 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  67.93 
 
 		 298 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  68.31 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  64.38 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  63.89 
 
 		 304 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  55.87 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  53.41 
 
 		 284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  54.74 
 
 		 284 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  52.48 
 
 		 285 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  52.84 
 
 		 284 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  52.67 
 
 		 286 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  48.92 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  48.8 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  49.11 
 
 		 284 aa  279  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  46.67 
 
 		 287 aa  278  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  48.97 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  50.36 
 
 		 285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  48.75 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  48.38 
 
 		 279 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  49.64 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  47.55 
 
 		 289 aa  259  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  48.23 
 
 		 286 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  49.45 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  47.52 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  47.52 
 
 		 286 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  45.68 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  43.12 
 
 		 279 aa  238  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  42.18 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  41.58 
 
 		 285 aa  232  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  43.32 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  42.29 
 
 		 296 aa  227  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  41.81 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  44.77 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  42.96 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  41.28 
 
 		 282 aa  222  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  40.68 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  40.13 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  44.33 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  44.33 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  44.33 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  42.75 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  43.99 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  43.99 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  43.99 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  43.49 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  40.43 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  41.58 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  41.67 
 
 		 283 aa  215  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  36.79 
 
 		 301 aa  215  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  43.05 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  43.49 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  38.18 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  43.45 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  43.2 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  38.46 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  41.46 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  38.98 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  41.58 
 
 		 337 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  39.8 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  42.86 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  42.71 
 
 		 290 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  42.71 
 
 		 290 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  37.46 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  42.71 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  39.05 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  38.57 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  39.93 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  43.05 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  38.98 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  39.66 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  37.41 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22075  putative pirin-related protein  50.47 
 
 		 210 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000698368  hitchhiker  1.59239e-20 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  41.89 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  39.93 
 
 		 282 aa  205  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  39.53 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  39.04 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  38.68 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  39.19 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  36.95 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  39.73 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  39.79 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  38.71 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  38.41 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  37.37 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  45.67 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  42.64 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  37.15 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  39.53 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  39.01 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  37.89 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  38.33 
 
 		 286 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>